31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49115 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  100 
 
 
870 aa  1821    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  58.6 
 
 
953 aa  916    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  45.47 
 
 
843 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  43.37 
 
 
810 aa  598  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  41.62 
 
 
880 aa  574  1.0000000000000001e-162  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  37.83 
 
 
827 aa  509  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  37.22 
 
 
831 aa  501  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  35.27 
 
 
876 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50634  predicted protein  51.37 
 
 
528 aa  392  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324652  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  33.33 
 
 
1256 aa  325  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46198  predicted protein  54.29 
 
 
445 aa  318  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930439  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36105  predicted protein  54.29 
 
 
419 aa  316  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.592861  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  28.03 
 
 
446 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  24.32 
 
 
431 aa  97.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  27.2 
 
 
407 aa  95.1  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  27.2 
 
 
410 aa  95.1  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  27.2 
 
 
407 aa  94.4  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  24.06 
 
 
431 aa  94  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  24.84 
 
 
402 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  25.44 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  27.18 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  23.38 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  22.38 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  25 
 
 
388 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  23.61 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0086  hypothetical protein  27.21 
 
 
384 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4715  hypothetical protein  22.99 
 
 
394 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  25.49 
 
 
395 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  21.46 
 
 
340 aa  46.6  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>