More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49056 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  100 
 
 
504 aa  1049    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  52.8 
 
 
461 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  51.52 
 
 
460 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  48.71 
 
 
461 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  51.29 
 
 
459 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  47.4 
 
 
461 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  48.6 
 
 
460 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  46.71 
 
 
511 aa  433  1e-120  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  49.53 
 
 
458 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  49.77 
 
 
458 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  46.91 
 
 
461 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  46.91 
 
 
461 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  45.89 
 
 
463 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  46.98 
 
 
465 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  46.25 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  46.65 
 
 
461 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  45.81 
 
 
469 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  44.3 
 
 
463 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  46.97 
 
 
465 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  45.71 
 
 
467 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  45.18 
 
 
517 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  44.42 
 
 
471 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  44.75 
 
 
469 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  45.38 
 
 
469 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  45.73 
 
 
461 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  45.73 
 
 
471 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  42.7 
 
 
474 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  43.01 
 
 
465 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  44.97 
 
 
469 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  44.02 
 
 
463 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  44.02 
 
 
463 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  43.38 
 
 
471 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  45.06 
 
 
470 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  44.64 
 
 
470 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  44.44 
 
 
470 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  44.44 
 
 
470 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01150  threonine synthase, putative  42.38 
 
 
547 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.779366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  44.3 
 
 
469 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  44.57 
 
 
465 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  44.02 
 
 
468 aa  381  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  44.85 
 
 
462 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  44.21 
 
 
466 aa  381  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  45.14 
 
 
469 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  44.09 
 
 
469 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  42.61 
 
 
463 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  44.09 
 
 
471 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  44.33 
 
 
469 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  44.33 
 
 
469 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  44.52 
 
 
469 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  45.61 
 
 
466 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  44.33 
 
 
469 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  44.49 
 
 
465 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  43.59 
 
 
470 aa  369  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  43.52 
 
 
462 aa  367  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  43.29 
 
 
472 aa  360  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  41.49 
 
 
477 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  43.97 
 
 
462 aa  356  5.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  41.16 
 
 
460 aa  355  1e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  44.11 
 
 
435 aa  355  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  41.61 
 
 
480 aa  353  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  43.33 
 
 
465 aa  353  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0932  threonine synthase  42.15 
 
 
482 aa  352  8e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.713242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  42.19 
 
 
471 aa  352  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  41.35 
 
 
470 aa  350  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  43.44 
 
 
471 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  41.6 
 
 
472 aa  349  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  41.06 
 
 
473 aa  349  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  44.47 
 
 
473 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  39.87 
 
 
475 aa  346  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  42.21 
 
 
472 aa  346  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  43.07 
 
 
467 aa  343  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  39.46 
 
 
473 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  40.33 
 
 
473 aa  341  1e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  40.3 
 
 
475 aa  342  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  41.34 
 
 
476 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  39.75 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  40.66 
 
 
483 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  40.38 
 
 
475 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  40.37 
 
 
481 aa  339  8e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  39.96 
 
 
476 aa  338  9.999999999999999e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  40.7 
 
 
483 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  40.79 
 
 
483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  41.74 
 
 
472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6226  threonine synthase  40.5 
 
 
483 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.745231  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1853  threonine synthase  40.5 
 
 
483 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  40.5 
 
 
483 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  40.5 
 
 
483 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1992  threonine synthase  40.17 
 
 
482 aa  335  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  39.59 
 
 
516 aa  335  1e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  41.36 
 
 
483 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0023  threonine synthase  41.36 
 
 
483 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1384  threonine synthase  41.36 
 
 
483 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2395  threonine synthase  41.36 
 
 
483 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1874  threonine synthase  41.36 
 
 
483 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  41.36 
 
 
483 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1791  threonine synthase  40.17 
 
 
483 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.50005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1146  threonine synthase  41.36 
 
 
483 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0318378  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  41.53 
 
 
472 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  40.58 
 
 
483 aa  333  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  40.08 
 
 
483 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>