More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48900 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48900  predicted protein  100 
 
 		 456 aa  942    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.87 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.55 
 
 		 357 aa  325  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  45.74 
 
 		 384 aa  300  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  43.8 
 
 		 348 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.53 
 
 		 364 aa  293  6e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.82 
 
 		 364 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.5 
 
 		 362 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.3 
 
 		 362 aa  289  8e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  44.17 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  42.49 
 
 		 374 aa  288  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.89 
 
 		 362 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.01 
 
 		 364 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.15 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 		 364 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  44.29 
 
 		 361 aa  286  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.4 
 
 		 354 aa  286  8e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 		 364 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55711  dihydroorotate dehydrogenase  41.69 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.486902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0500  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.04 
 
 		 361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.814965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.39 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.1 
 
 		 352 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.44 
 
 		 364 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.84 
 
 		 364 aa  279  6e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.98 
 
 		 355 aa  279  7e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.62 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.13 
 
 		 363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.68 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.73 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.66 
 
 		 348 aa  273  6e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.01 
 
 		 362 aa  272  1e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2471  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.73 
 
 		 363 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.325849  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.26 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.6 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.6 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.53 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.26 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.95 
 
 		 344 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2221  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.32 
 
 		 357 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.38 
 
 		 358 aa  266  5e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.77 
 
 		 356 aa  266  7e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.71 
 
 		 364 aa  266  8e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.71 
 
 		 364 aa  266  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.37 
 
 		 359 aa  266  8e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  42.69 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.23 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  38.87 
 
 		 348 aa  263  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.29 
 
 		 343 aa  263  6e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.31 
 
 		 377 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1958  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.78 
 
 		 356 aa  262  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139268 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5166  dihydroorotate dehydrogenase  42.59 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.4 
 
 		 351 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  42.41 
 
 		 339 aa  259  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  41.32 
 
 		 377 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1738  dihydroorotate oxidase  43.64 
 
 		 346 aa  257  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1157  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.36 
 
 		 357 aa  256  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  42.38 
 
 		 336 aa  256  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1961  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.89 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.779789  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.11 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0290  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.15 
 
 		 378 aa  254  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  41 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.54 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.36 
 
 		 358 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.66 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.75 
 
 		 344 aa  253  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4359  dihydroorotate dehydrogenase  42.77 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.42236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2662  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.69 
 
 		 364 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.545588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  44.32 
 
 		 336 aa  253  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1224  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.8 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.234745  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3458  dihydroorotate dehydrogenase  42.05 
 
 		 356 aa  252  8.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.101666  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3174  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.01 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2566  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.95 
 
 		 364 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.06304  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1646  dihydroorotate dehydrogenase  43.39 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.353277  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0019  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.99 
 
 		 360 aa  252  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.146471  normal  0.113107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3162  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.01 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3224  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.01 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.425254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.27 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 		 336 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  42.37 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0288  dihydroorotate dehydrogenase  43.29 
 
 		 361 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2130  dihydroorotate dehydrogenase  40.69 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.540682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0211  dihydroorotate oxidase  40.82 
 
 		 342 aa  249  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00949  dihydroorotate dehydrogenase  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000020271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2698  Dihydroorotate oxidase  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1054  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000778438  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2651  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000533982  hitchhiker  0.00158114 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1109  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000226851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00956  hypothetical protein  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2372  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000164605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.76 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2437  dihydroorotate oxidase  38.96 
 
 		 367 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2299  dihydroorotate oxidase  42.21 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.189088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1060  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.97 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1664  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 344 aa  248  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0155607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  45.23 
 
 		 396 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  40.91 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  43.18 
 
 		 336 aa  248  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  41.62 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  39.37 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.05 
 
 		 343 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>