17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48855 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48855  predicted protein  100 
 
 
903 aa  1858    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105124  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29087  predicted protein  28.65 
 
 
480 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04599  Protein grc3 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B4D1]  35.48 
 
 
816 aa  90.5  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1123  hypothetical protein  29.95 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000483449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0084  hypothetical protein  28.88 
 
 
353 aa  70.1  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33311  predicted protein  28 
 
 
663 aa  66.6  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.567773  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_006686  CND04240  conserved hypothetical protein  28.82 
 
 
744 aa  62.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0075  hypothetical protein  29.41 
 
 
355 aa  58.2  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.109256 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0047  hypothetical protein  29.5 
 
 
353 aa  57.8  0.0000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0041  hypothetical protein  28.75 
 
 
439 aa  56.6  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.395847  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0849  hypothetical protein  26.82 
 
 
431 aa  56.2  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0769566 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1914  hypothetical protein  25.65 
 
 
429 aa  53.9  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1404  hypothetical protein  27.74 
 
 
425 aa  52.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0955  hypothetical protein  29.11 
 
 
428 aa  51.6  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0398  AAA ATPase  26.97 
 
 
287 aa  48.9  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0989  GTPase or GTP-binding protein-like protein  24.49 
 
 
371 aa  46.6  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0195  GTPase or GTP-binding protein  21.32 
 
 
421 aa  45.8  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>