105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48408 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  100 
 
 
577 aa  1197    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  30.7 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  28.51 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  27.4 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  27.4 
 
 
468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  27.19 
 
 
486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.84 
 
 
495 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  28.03 
 
 
495 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  26.67 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  28.35 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  26.73 
 
 
510 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  24.9 
 
 
491 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  26.85 
 
 
472 aa  123  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  27.71 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  26.62 
 
 
501 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  25.97 
 
 
477 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  25.61 
 
 
514 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  25.62 
 
 
485 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  24.72 
 
 
477 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  24.45 
 
 
765 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  26.29 
 
 
477 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  25.29 
 
 
463 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 
517 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  24.76 
 
 
509 aa  97.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  25.4 
 
 
467 aa  97.1  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  24.4 
 
 
467 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  24.7 
 
 
467 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  24.29 
 
 
467 aa  94.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  24.71 
 
 
488 aa  94  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  24.12 
 
 
460 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  26.08 
 
 
520 aa  89.7  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  26.1 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  24.8 
 
 
507 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  25.68 
 
 
472 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  22.18 
 
 
497 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  25 
 
 
467 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  22.18 
 
 
497 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  23.21 
 
 
494 aa  80.9  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  25.53 
 
 
441 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  25.15 
 
 
508 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  25.15 
 
 
508 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.86 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  22.59 
 
 
495 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  25.38 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  22.5 
 
 
464 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  24.9 
 
 
914 aa  77  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  25.51 
 
 
478 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  24.05 
 
 
499 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  22.78 
 
 
494 aa  75.1  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  25.86 
 
 
444 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  26.25 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  24.08 
 
 
504 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  24.36 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  35.78 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  23.86 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  22.28 
 
 
515 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  23.93 
 
 
481 aa  66.2  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  34.86 
 
 
445 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  34.86 
 
 
445 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  25.1 
 
 
451 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  25.1 
 
 
451 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  26.82 
 
 
445 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  30.33 
 
 
489 aa  64.3  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  25.1 
 
 
451 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  33.94 
 
 
445 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  32.62 
 
 
502 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  21.84 
 
 
533 aa  63.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  33.03 
 
 
443 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  31.09 
 
 
494 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  32.28 
 
 
467 aa  62.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  23.87 
 
 
479 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  29.7 
 
 
556 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  29.7 
 
 
558 aa  60.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  21.76 
 
 
488 aa  60.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  29.7 
 
 
554 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  21.75 
 
 
487 aa  60.1  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  29.09 
 
 
556 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  32.89 
 
 
163 aa  59.7  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  37.21 
 
 
480 aa  58.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  28.41 
 
 
495 aa  57.4  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  26.7 
 
 
497 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  35.63 
 
 
501 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  30.21 
 
 
470 aa  55.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  32.35 
 
 
487 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  32.35 
 
 
487 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  29.82 
 
 
554 aa  53.9  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  32.97 
 
 
443 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  32.97 
 
 
443 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  32.97 
 
 
443 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  32.97 
 
 
443 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  32.97 
 
 
443 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  32.97 
 
 
443 aa  53.5  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  37.68 
 
 
443 aa  53.5  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  26.81 
 
 
488 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.57 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  20.11 
 
 
551 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  26.46 
 
 
498 aa  48.9  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  23.22 
 
 
512 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  26.4 
 
 
555 aa  47.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25051  hypothetical protein  32.2 
 
 
64 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>