More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48316 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48316  predicted protein  100 
 
 		 314 aa  648    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00626379  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50212  predicted protein  95.86 
 
 		 314 aa  563  1.0000000000000001e-159  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.798416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1401  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 186 aa  90.5  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.100309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3265  ribosome recycling factor  32.61 
 
 		 186 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0529  ribosome recycling factor  35.36 
 
 		 185 aa  89.4  7e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2360  ribosome recycling factor  33.52 
 
 		 187 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.22214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2086  ribosome recycling factor  33.52 
 
 		 187 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.192418  normal  0.15793 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0375  ribosome recycling factor  29.21 
 
 		 182 aa  89.4  8e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2046  ribosome recycling factor  32.97 
 
 		 187 aa  89  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.89448  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1697  ribosome recycling factor  32.07 
 
 		 194 aa  88.6  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  34.83 
 
 		 185 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  30.9 
 
 		 185 aa  88.2  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2152  ribosome recycling factor  28.09 
 
 		 188 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.536233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  30.22 
 
 		 195 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2854  ribosome recycling factor  32.07 
 
 		 187 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.144432  normal  0.265175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  30 
 
 		 185 aa  87  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1363  ribosome recycling factor  27.53 
 
 		 188 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00468039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4436  ribosome recycling factor  31.91 
 
 		 187 aa  87  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000669828 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1843  ribosome recycling factor  32 
 
 		 185 aa  86.7  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1856  ribosome recycling factor  31.52 
 
 		 187 aa  86.7  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791714  normal  0.0290341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1586  ribosome recycling factor  30.05 
 
 		 186 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2706  ribosome recycling factor  28.57 
 
 		 188 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.957438  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  31.25 
 
 		 185 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0300  ribosome recycling factor  31.32 
 
 		 186 aa  85.9  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1957  ribosome recycling factor  31.15 
 
 		 184 aa  85.9  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  29.44 
 
 		 185 aa  85.9  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2692  ribosome recycling factor  31.07 
 
 		 186 aa  85.5  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1783  ribosome recycling factor  32.76 
 
 		 185 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00108157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2521  ribosome recycling factor  30.22 
 
 		 186 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.277739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1413  ribosome recycling factor  28.02 
 
 		 187 aa  85.5  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.889728  normal  0.194184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1134  ribosome recycling factor  30.6 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  32.58 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2439  ribosome recycling factor  32.07 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.66949  normal  0.174209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  32.57 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  33.71 
 
 		 185 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4514  ribosome recycling factor  32.07 
 
 		 187 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.167395  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  29.79 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1779  ribosome recycling factor  29.51 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1589  ribosome recycling factor  30.56 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.609942  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1278  ribosome recycling factor  33.9 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  31.32 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2825  ribosome recycling factor  30.43 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3446  ribosome recycling factor  32.58 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0960945  normal  0.455289 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1517  ribosome recycling factor  30.51 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  31.03 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  31.67 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  31.46 
 
 		 185 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1407  ribosome recycling factor  29.38 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  34.27 
 
 		 185 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0528  ribosome recycling factor  28.98 
 
 		 185 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1149  ribosome recycling factor  31.64 
 
 		 185 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2032  ribosome recycling factor  28.57 
 
 		 186 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0616  ribosome recycling factor  30.86 
 
 		 187 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  32.29 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1594  ribosome recycling factor  31.07 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409738  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  31.49 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4183  ribosome recycling factor  31.07 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1527  ribosome recycling factor  28.73 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00139576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1557  ribosome recycling factor  31.55 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  31.64 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  31.64 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1862  ribosome recycling factor  29.71 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.964954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2847  ribosome recycling factor  29.94 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  31.64 
 
 		 185 aa  81.3  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  30.16 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1537  ribosome recycling factor  30.22 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1430  ribosome recycling factor  29.95 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  27.47 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4079  ribosome recycling factor  31.07 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  29.94 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  30.51 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  31.28 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  29.71 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  31.43 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  31.43 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1448  ribosome recycling factor  31.43 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000214173  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1372  ribosome recycling factor  32.34 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0601267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  30.51 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1484  ribosome recycling factor  31.43 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000709639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1273  ribosome recycling factor  29.41 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0235676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3050  ribosome recycling factor  30.51 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.672962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1494  ribosome recycling factor  28.25 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.280653  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  28.89 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0348  ribosome recycling factor  30.29 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000142199  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  31.67 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3832  ribosome recycling factor  30.22 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl555  ribosome recycling factor  30.91 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.862763  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  30.68 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  30.73 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  29.95 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1761  ribosome recycling factor  28.73 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0665089 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2458  ribosome recycling factor  25.26 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000401081 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  28.73 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>