17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48313 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48313  predicted protein  100 
 
 
616 aa  1288    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00387548  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45722  predicted protein  37.02 
 
 
725 aa  331  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454652  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44271  predicted protein  35.3 
 
 
645 aa  288  2e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166766  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44421  predicted protein  33.01 
 
 
1206 aa  287  4e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130794  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44270  predicted protein  32.95 
 
 
628 aa  272  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000597333  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46010  predicted protein  32.62 
 
 
511 aa  227  5.0000000000000005e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42590  predicted protein  29.45 
 
 
634 aa  207  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47891  predicted protein  28.41 
 
 
867 aa  200  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49977  predicted protein  33.8 
 
 
578 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  29.31 
 
 
1987 aa  190  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42606  predicted protein  27.3 
 
 
630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.703916  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45293  predicted protein  34.81 
 
 
533 aa  173  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45034  predicted protein  34.11 
 
 
510 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000000346108  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44525  predicted protein  34.5 
 
 
544 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48986  predicted protein  34.63 
 
 
780 aa  114  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.212734  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40329  predicted protein  26.67 
 
 
296 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.524213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1424  nuclear protein SET  26.32 
 
 
150 aa  44.3  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>