206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48282 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  100 
 
 		 1567 aa  3188    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  84.57 
 
 		 1222 aa  1355    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40470  predicted protein  93.36 
 
 		 256 aa  484  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  36.47 
 
 		 807 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  36.56 
 
 		 805 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  36.56 
 
 		 858 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  36.56 
 
 		 800 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.56 
 
 		 858 aa  426  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  36.56 
 
 		 800 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  36.43 
 
 		 858 aa  423  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  47.31 
 
 		 638 aa  423  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  37.88 
 
 		 806 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  37.88 
 
 		 806 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  37.88 
 
 		 806 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.88 
 
 		 806 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  37.77 
 
 		 806 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  37.77 
 
 		 806 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  37.77 
 
 		 806 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  37 
 
 		 806 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  43.22 
 
 		 1100 aa  362  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  42.5 
 
 		 1000 aa  350  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47779  predicted protein  45.48 
 
 		 622 aa  253  3e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  31.02 
 
 		 918 aa  231  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45751  predicted protein  46.75 
 
 		 386 aa  218  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0607057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  31.79 
 
 		 593 aa  193  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45750  predicted protein  49.43 
 
 		 262 aa  192  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0489312  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33498  predicted protein  54.1 
 
 		 187 aa  172  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39243  predicted protein  56.47 
 
 		 168 aa  166  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38076  predicted protein  54.39 
 
 		 446 aa  165  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3239  hypothetical protein  39.79 
 
 		 931 aa  162  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_40038  predicted protein  48.78 
 
 		 214 aa  160  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0610628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  31.28 
 
 		 781 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  31.07 
 
 		 781 aa  150  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  37.25 
 
 		 1140 aa  148  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  26.92 
 
 		 759 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  28.73 
 
 		 831 aa  140  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2756  galactose oxidase  28.46 
 
 		 797 aa  137  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.760329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1030 aa  136  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  26.19 
 
 		 909 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  26.19 
 
 		 947 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  25.65 
 
 		 517 aa  112  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 2082 aa  90.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02635  hypothetical protein  31.91 
 
 		 757 aa  90.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  34.53 
 
 		 436 aa  90.5  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  25.97 
 
 		 3320 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  35.21 
 
 		 497 aa  86.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.28 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  45.58 
 
 		 1000 aa  82.8  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  35.43 
 
 		 672 aa  79.7  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  33.8 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  24.78 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0623  hypothetical protein  28.14 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000504443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  23.82 
 
 		 1245 aa  74.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  39.77 
 
 		 482 aa  73.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  34.43 
 
 		 726 aa  72.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.86 
 
 		 466 aa  72  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  25.95 
 
 		 423 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  31.85 
 
 		 789 aa  71.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  28.38 
 
 		 644 aa  70.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  32.33 
 
 		 1139 aa  69.7  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  31.97 
 
 		 1148 aa  69.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  34.92 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 495 aa  68.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.25 
 
 		 830 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  32.28 
 
 		 691 aa  67.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4195  hypothetical protein  21.46 
 
 		 650 aa  67  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  30.47 
 
 		 1016 aa  66.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  28.48 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  33.86 
 
 		 520 aa  67  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.45 
 
 		 507 aa  67  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  32.79 
 
 		 652 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  32.8 
 
 		 794 aa  66.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  32.79 
 
 		 652 aa  66.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  27.41 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  26.87 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  27.88 
 
 		 1187 aa  65.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  30.6 
 
 		 560 aa  65.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.13 
 
 		 884 aa  64.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  25.79 
 
 		 484 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.32 
 
 		 646 aa  64.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  26.86 
 
 		 377 aa  63.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4926  Ricin B lectin  35.34 
 
 		 748 aa  63.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164927  normal  0.377281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  28.35 
 
 		 957 aa  63.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  32.81 
 
 		 430 aa  62  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  30.47 
 
 		 566 aa  62  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  43.8 
 
 		 590 aa  61.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  29.58 
 
 		 411 aa  60.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  27.01 
 
 		 450 aa  60.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  27.69 
 
 		 493 aa  60.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.69 
 
 		 531 aa  60.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  31.47 
 
 		 504 aa  60.1  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  32.28 
 
 		 618 aa  60.1  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  26.14 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  31.67 
 
 		 1049 aa  58.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  29.53 
 
 		 563 aa  58.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  27.78 
 
 		 558 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  26.32 
 
 		 448 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  28.66 
 
 		 172 aa  58.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  26.19 
 
 		 472 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>