15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47966 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47966  predicted protein  100 
 
 		 391 aa  813    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  29.68 
 
 		 609 aa  150  5e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  24.67 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3784  Glycoprotein endo-alpha-1,2-mannosidase  24.05 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00391126  normal  0.836971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4327  hypothetical protein  28.65 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.885566  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0297  endo-alpha-mannosidase  26.37 
 
 		 348 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  21.32 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000156846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  21.02 
 
 		 381 aa  53.9  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.41 
 
 		 357 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 363 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.15 
 
 		 364 aa  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  24.66 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.66 
 
 		 957 aa  46.6  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  23.39 
 
 		 695 aa  44.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>