12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46618 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46618  predicted protein  100 
 
 
570 aa  1182    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3598  HTTM domain protein  26.64 
 
 
521 aa  84.7  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1644  HTTM  26.97 
 
 
602 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0078  HTTM domain protein  24.84 
 
 
613 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0076  HTTM domain protein  24.84 
 
 
613 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.373411  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2906  HTTM domain protein  23.53 
 
 
497 aa  69.7  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147684  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2239  hypothetical protein  22.52 
 
 
529 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2175  HTTM domain protein  27.88 
 
 
605 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2237  HTTM domain protein  27.88 
 
 
605 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5635  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1197  hypothetical protein  30.72 
 
 
562 aa  51.2  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1979  hypothetical protein  23.26 
 
 
531 aa  50.8  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2331  HTTM domain protein  23.53 
 
 
523 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.524598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>