218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46593 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  47.3 
 
 		 213 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  68.42 
 
 		 81 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  68.42 
 
 		 81 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  68.42 
 
 		 81 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  68.42 
 
 		 81 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  68.42 
 
 		 81 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  69.74 
 
 		 76 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  68.42 
 
 		 81 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  64.47 
 
 		 81 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.74 
 
 		 79 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  68.92 
 
 		 81 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  67.11 
 
 		 81 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.74 
 
 		 79 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  69.74 
 
 		 81 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  61.84 
 
 		 81 aa  112  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.47 
 
 		 76 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  67.11 
 
 		 81 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  63.16 
 
 		 79 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  68.92 
 
 		 80 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  48.61 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  48.61 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  48.61 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.93 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  52.11 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  52.86 
 
 		 86 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  49.3 
 
 		 73 aa  75.5  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  46.81 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.28 
 
 		 73 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  53.52 
 
 		 74 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  49.3 
 
 		 74 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  52.11 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 72 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.28 
 
 		 73 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  54.29 
 
 		 73 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.12 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.12 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.39 
 
 		 78 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.39 
 
 		 78 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  55 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  43.37 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  41.49 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  51.43 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  48.53 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.61 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  45.33 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  45.33 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  49.25 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  45.33 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  47.76 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  37.11 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.61 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 96 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.86 
 
 		 85 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.58 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  42.86 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  45.59 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.38 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  51.43 
 
 		 72 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  55.71 
 
 		 72 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  41.43 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  54.29 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  44.44 
 
 		 86 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  47.06 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  44.44 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  45.59 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.59 
 
 		 73 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  44.44 
 
 		 89 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  46.55 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.26 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  43.28 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  40.91 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  44.26 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  40.91 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  44.26 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  40.91 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.89 
 
 		 87 aa  62  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 77 aa  62  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 86 aa  61.6  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.26 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  44 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  45.9 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  43.75 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  41.67 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>