55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46275 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46275  predicted protein  100 
 
 		 427 aa  898    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0284  fatty acid desaturase  29.54 
 
 		 336 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2765  fatty acid desaturase  27.16 
 
 		 324 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3955  fatty acid desaturase  26.37 
 
 		 330 aa  93.2  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.303691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2767  fatty acid desaturase  25.14 
 
 		 363 aa  86.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1713  hydrocarbon oxygenase MocD  26.28 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1456  fatty acid desaturase  24.86 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2682  fatty acid desaturase  27.72 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.472313  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2071  fatty acid desaturase  27.72 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349993  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3907  fatty acid desaturase  25.5 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6010  Fatty acid desaturase  30.06 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2711  fatty acid desaturase  28.29 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.302824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6028  fatty acid desaturase  26.05 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.140521  normal  0.442849 
 
 
-
 
NC_003296  RS01923  putative omega-3 fatty acid desaturase transmembrane protein  26.52 
 
 		 325 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00198957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0615  fatty acid desaturase  28.74 
 
 		 378 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2735  fatty acid desaturase  29.07 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7183  fatty acid desaturase  25 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0292257  normal  0.0391635 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.44 
 
 		 765 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517485  normal  0.766307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5007  fatty acid desaturase  24.62 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.427565  normal  0.0159789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3304  fatty acid desaturase  24.54 
 
 		 358 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  24.92 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0334  fatty acid desaturase  23.65 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00245875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0400  fatty acid desaturase  23.24 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4904  fatty acid desaturase  23.24 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0414  fatty acid desaturase  23.24 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0462  fatty acid desaturase  22.82 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0057  fatty acid desaturase  27.02 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0366  fatty acid desaturase  23.24 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0337  fatty acid desaturase  23.24 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000637477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0351  fatty acid desaturase  23.24 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0466  fatty acid desaturase  22.82 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1751  fatty acid desaturase  26.14 
 
 		 311 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0693736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0346  fatty acid desaturase  22.59 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0282  fatty acid desaturase  26.12 
 
 		 540 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.652623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0342  fatty acid desaturase  23.55 
 
 		 360 aa  53.9  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7514  fatty acid desaturase  21.05 
 
 		 311 aa  53.5  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.748697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2725  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0066  fatty acid desaturase family protein  26.42 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1828  MocD  26.42 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3479  fatty acid desaturase  26.42 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0068  fatty acid desaturase family protein  26.42 
 
 		 328 aa  53.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2886  fatty acid desaturase  22.98 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2666  fatty acid desaturase  22.42 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.180267  normal  0.261015 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0361  fatty acid desaturase  31.87 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0669  fatty acid desaturase  22.52 
 
 		 362 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5042  fatty acid desaturase  28.95 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1878  fatty acid desaturase  22.76 
 
 		 364 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.19298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0650  fatty acid desaturase  27.07 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871112  normal  0.375264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5215  fatty acid desaturase  24.16 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3401  fatty acid desaturase  24.37 
 
 		 372 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000180374  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2352  fatty acid desaturase  23.27 
 
 		 328 aa  43.9  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3322  hypothetical protein  23.92 
 
 		 356 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3679  fatty acid desaturase  24.51 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2182  fatty acid desaturase  26.36 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0979367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7780  fatty acid desaturase  32.93 
 
 		 353 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>