88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46220 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  100 
 
 
356 aa  745    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  33.85 
 
 
366 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36516  predicted protein  31.58 
 
 
345 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01140  conserved hypothetical protein  31.44 
 
 
346 aa  145  8.000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599641  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  29.67 
 
 
447 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  29.19 
 
 
447 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1057  hypothetical protein  31.16 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  87  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  28 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  32.69 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  26.17 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  29.3 
 
 
276 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  29.86 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  26.96 
 
 
267 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  30.94 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0033  protein of unknown function DUF52  32.35 
 
 
263 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  28.22 
 
 
282 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  31.53 
 
 
266 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  29.61 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  23.92 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  24.22 
 
 
298 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  24.04 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6306  hypothetical protein  29.76 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  26.91 
 
 
277 aa  72.8  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0307  protein of unknown function DUF52  25.48 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000324759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  28.02 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  24.46 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  23.14 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  26.42 
 
 
274 aa  70.9  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  26.72 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  27.27 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  26.67 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1105  hypothetical protein  24.4 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  24.61 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  22.92 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  27.14 
 
 
274 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  25.47 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  28.37 
 
 
274 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  22.19 
 
 
284 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0062  hypothetical protein  22.39 
 
 
281 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.853485  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5677  protein of unknown function DUF52  25.69 
 
 
275 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  25.23 
 
 
262 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0028  hypothetical protein  24.63 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0059  hypothetical protein  23.89 
 
 
282 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0213251 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  22.86 
 
 
275 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  27.49 
 
 
481 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  22.46 
 
 
267 aa  63.9  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  26.17 
 
 
274 aa  63.5  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  25.34 
 
 
284 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  29.25 
 
 
264 aa  63.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2556  protein of unknown function DUF52  27.36 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.323501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  25.6 
 
 
267 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1848  hypothetical protein  25.7 
 
 
262 aa  61.6  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  22.94 
 
 
269 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  25.71 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0933  protein of unknown function DUF52  24.58 
 
 
262 aa  61.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000087287  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1094  hypothetical protein  25.23 
 
 
438 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  28 
 
 
284 aa  59.3  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1957  hypothetical protein  26.7 
 
 
267 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0594008  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2429  hypothetical protein  25.35 
 
 
484 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000652798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1742  hypothetical protein  23.81 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0420236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2247  hypothetical protein  23.77 
 
 
267 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  27.14 
 
 
265 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  24.84 
 
 
279 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  23.2 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1268  hypothetical protein  29.66 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  24.02 
 
 
284 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_002936  DET1313  hypothetical protein  24.7 
 
 
438 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  26.53 
 
 
266 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1122  hypothetical protein  25.53 
 
 
438 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  24.88 
 
 
301 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  27.01 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0837  hypothetical protein  21.97 
 
 
277 aa  53.5  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.543815  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  22.09 
 
 
287 aa  53.1  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  27.17 
 
 
267 aa  52.8  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0299  hypothetical protein  24.41 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  21.61 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  23.26 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  25 
 
 
284 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  26.92 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  24.41 
 
 
299 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  26.69 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  21.67 
 
 
405 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  23.34 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0208  protein of unknown function DUF52  22.77 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0860  hypothetical protein  21.79 
 
 
277 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.671091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  23.94 
 
 
299 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>