85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45998 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_45998  predicted protein  100 
 
 
250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.0000053085  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27508  predicted protein  99.16 
 
 
269 aa  486  1e-136  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06547  proteasome component Pre5, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G04790)  48.55 
 
 
259 aa  236  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.321161  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55136  predicted protein  47.48 
 
 
299 aa  228  9e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05540  proteasome subunit alpha type 1, putative  49.54 
 
 
299 aa  222  4e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000947044  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119643  alpha-type C2 proteasome subunit  41.53 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0181  proteasome subunit alpha  37.79 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0584  proteasome subunit alpha  40.1 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12149  predicted protein  38.38 
 
 
258 aa  135  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01660  hypothetical protein  37.38 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3313  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  41 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1795  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  35.55 
 
 
241 aa  132  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.344209  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38146  predicted protein  38.05 
 
 
237 aa  129  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1929  proteasome subunit alpha  43.1 
 
 
243 aa  130  3e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05872  alpha subunit of the 20S proteasome (Eurofung)  39.04 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2663  proteasome subunit alpha  38.94 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1253  proteasome subunit alpha  37.5 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1422  proteasome subunit alpha  36.87 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.186141  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1390  proteasome subunit alpha  41.67 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.804197  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0702  proteasome subunit alpha  37.04 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.959653  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1707  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.5 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119626  Proteasome subunit alpha type 4-like protein  39.11 
 
 
231 aa  126  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00724028  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0196  proteasome subunit alpha  38.97 
 
 
263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000616986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1264  proteasome subunit alpha  35.94 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0963  proteasome subunit alpha  37.38 
 
 
267 aa  125  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.270146  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87371  predicted protein  37.97 
 
 
257 aa  125  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01360  proteasome subunit alpha type 5, putative  40.33 
 
 
270 aa  124  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.829356  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0844  proteasome subunit alpha  41.38 
 
 
251 aa  124  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.667486  normal  0.166899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0936  proteasome subunit alpha  39.66 
 
 
242 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2401  proteasome subunit alpha  38.79 
 
 
250 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2802  proteasome subunit alpha  38.32 
 
 
271 aa  123  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2503  proteasome subunit alpha  37.81 
 
 
249 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0074  proteasome subunit alpha  35.07 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000128954  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28202  proteasome subunit alpha  39.34 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0019  proteasome subunit alpha  39.55 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2273  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  39.66 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1822  proteasome subunit alpha  37.56 
 
 
240 aa  118  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0811  proteasome subunit alpha  38.37 
 
 
245 aa  116  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.482336 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2526  proteasome subunit alpha  34.47 
 
 
241 aa  115  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.412053  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1365  proteasome subunit alpha  33.47 
 
 
240 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.800783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0515  Proteasome endopeptidase complex  36.67 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1678  proteasome subunit alpha  37 
 
 
240 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82713  predicted protein  32.52 
 
 
250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0184174  normal  0.129752 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1341  proteasome subunit alpha  34.47 
 
 
272 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20981  hitchhiker  0.00320062 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19004  predicted protein  36.22 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01757  proteasome component Pre9, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08960)  36.57 
 
 
255 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1742  proteasome subunit alpha  37.91 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2282  proteasome subunit alpha  39.29 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24474  predicted protein  36.56 
 
 
264 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.417126  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63922  predicted protein  31.08 
 
 
233 aa  107  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.462622  normal  0.14589 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41065  predicted protein  30.42 
 
 
235 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.995662  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81403  predicted protein  35.05 
 
 
253 aa  106  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0672955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2172  proteasome subunit alpha  32.09 
 
 
268 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.151706  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0185  proteasome endopeptidase complex, alpha subunit  30.9 
 
 
243 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000839999  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03610  proteasome subunit alpha type 3, putative  36.36 
 
 
256 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661994  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61383  predicted protein  36.42 
 
 
250 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.235012  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49897  predicted protein  31.12 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626746  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01860  proteasome subunit alpha type 4, putative  32.16 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1314  proteasome subunit alpha  33.15 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000643956 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_5685  predicted protein  34.66 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346261  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04850  conserved hypothetical protein  30.24 
 
 
256 aa  96.7  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08054  proteasome component Pre6, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02150)  36.42 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06726  proteasome component Pre8, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05870)  31.02 
 
 
278 aa  94  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41449  predicted protein  30.67 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.220218 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04280  20S proteasome subunit, putative  31.64 
 
 
252 aa  92.4  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748663  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04869  proteasome core alpha 1 component (Eurofung)  29.41 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.378598 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41423  predicted protein  31.07 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0893368  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53939  proteasome alpha 1 subunit  30.1 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05793  proteasome subunit alpha type 3, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06350)  28.79 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0255334 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_5889  predicted protein  31.43 
 
 
180 aa  83.2  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_7255  predicted protein  29.48 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.153627  normal  0.0642401 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0754  proteasome endopeptidase complex  30.11 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.662481 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0916  proteasome endopeptidase complex  29.55 
 
 
203 aa  57  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.840423  normal  0.0288115 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  30.73 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2211  proteasome endopeptidase complex  32.02 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.208664  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0050  proteasome endopeptidase complex  26.07 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0307  proteasome endopeptidase complex  28.74 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1573  proteasome endopeptidase complex  28.12 
 
 
219 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.210251  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1254  proteasome endopeptidase complex, beta subunit  27.38 
 
 
196 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.264606  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1015  hypothetical protein  28.81 
 
 
212 aa  44.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.743194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0881  proteasome subunit beta  28.8 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.296506  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1790  proteasome subunit beta  33.1 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.568871  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0189  proteasome endopeptidase complex  28.27 
 
 
219 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1722  proteasome endopeptidase complex  28.27 
 
 
219 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.780704 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0083  proteasome endopeptidase complex  27.5 
 
 
207 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>