30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44907 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44907  predicted protein  100 
 
 
355 aa  730    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31731  predicted protein  39.94 
 
 
461 aa  273  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3051  hypothetical protein  40.53 
 
 
409 aa  260  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35270  hypothetical protein  34.39 
 
 
409 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01157  hypothetical protein  36.17 
 
 
402 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15260  predicted protein  36.21 
 
 
467 aa  223  3e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_35977  predicted protein  35.37 
 
 
551 aa  206  3e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.586118  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1953  hypothetical protein  33.63 
 
 
403 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.577972  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2608  hypothetical protein  27.7 
 
 
420 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1524  hypothetical protein  31.79 
 
 
392 aa  196  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0897  hypothetical protein  33.56 
 
 
454 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.744835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0798  hypothetical protein  27.47 
 
 
427 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.649832  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0801  hypothetical protein  27.71 
 
 
443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0523631  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1562  hypothetical protein  27.3 
 
 
444 aa  160  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0203187  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1744  hypothetical protein  27.02 
 
 
444 aa  158  1e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.463821  normal  0.325985 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2058  hypothetical protein  29.25 
 
 
199 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000110329  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0171  hypothetical protein  26.98 
 
 
204 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.192995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1088  hypothetical protein  22.71 
 
 
198 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.047449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1369  hypothetical protein  21.8 
 
 
201 aa  62  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294932  normal  0.453286 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05560  hypothetical protein  34.09 
 
 
201 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.15855e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1611  hypothetical protein  23.04 
 
 
200 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000477853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1385  hypothetical protein  29.37 
 
 
208 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000578714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1760  hypothetical protein  34.57 
 
 
197 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000219009  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2065  hypothetical protein  38.33 
 
 
198 aa  52.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1825  putative membrane protin  23.53 
 
 
202 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576193  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0899  hypothetical protein  31.88 
 
 
537 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.860186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0033  hypothetical protein  32.5 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.374714  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0823  hypothetical protein  27.93 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2530  hypothetical protein  28 
 
 
499 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2844  hypothetical protein  28 
 
 
499 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>