42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44673 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44673  predicted protein  100 
 
 
338 aa  702    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.173616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1815  hypothetical protein  25.83 
 
 
245 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.668291  normal  0.837266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0522  hypothetical protein  28.99 
 
 
231 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0552  hypothetical protein  29.11 
 
 
231 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3792  hypothetical protein  28.99 
 
 
231 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0547  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1558  hypothetical protein  26.75 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0437869  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2453  hypothetical protein  29.75 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5161  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1174  hypothetical protein  27.8 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.58275  normal  0.922982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2922  hypothetical protein  27.67 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.625248  normal  0.62395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2549  hypothetical protein  26.67 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_9586  predicted protein  44.74 
 
 
70 aa  76.6  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4822  hypothetical protein  25.3 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.75667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  29.71 
 
 
544 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1897  hypothetical protein  27.98 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.850537  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4494  hypothetical protein  22.18 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0480  hypothetical protein  29.11 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5898  hypothetical protein  29.81 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6868  hypothetical protein  29.56 
 
 
239 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4521  hypothetical protein  26.59 
 
 
244 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4635  hypothetical protein  26.54 
 
 
245 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  0.401732 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1991  hypothetical protein  25.32 
 
 
232 aa  64.3  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2269  hypothetical protein  26 
 
 
230 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4909  hypothetical protein  27.61 
 
 
246 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.983683  normal  0.108673 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04711  conserved hypothetical protein  24.73 
 
 
269 aa  63.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4153  hypothetical protein  27.61 
 
 
243 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.386846  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1107  hypothetical protein  29.01 
 
 
249 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44556  predicted protein  26.14 
 
 
484 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02160  hypothetical protein  22.91 
 
 
286 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1551  hypothetical protein  21.49 
 
 
246 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44864  predicted protein  27.72 
 
 
492 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0007  hypothetical protein  24.2 
 
 
248 aa  52.8  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00581263  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_3566  predicted protein  26.83 
 
 
342 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0529465  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0072  hypothetical protein  28.49 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0221  hypothetical protein  28.89 
 
 
400 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105596  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0074  hypothetical protein  28.49 
 
 
402 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4530  hypothetical protein  27.07 
 
 
397 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.355101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4748  hypothetical protein  25.14 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3059  hypothetical protein  25.37 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.788767  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1119  hypothetical protein  26.46 
 
 
398 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0692981  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72172  predicted protein  21.07 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.143035 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18359  predicted protein  26.79 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.523729  normal  0.0221416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>