16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44439 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44439  predicted protein  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02240  signal recognition particle protein, putative  30.77 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1273  signal recognition particle protein Srp19  34.62 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.831098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1829  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  38.24 
 
 		 93 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2790  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  36.67 
 
 		 92 aa  52.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60739  signal recognition particle subunit  36.62 
 
 		 276 aa  52.8  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.022276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1560  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  32.18 
 
 		 89 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.972556  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2116  signal recognition particle protein Srp19  33.33 
 
 		 104 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2505  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  34.44 
 
 		 92 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00643  signal recognition particle 19 kDa protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16820)  31.08 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0717  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  41.07 
 
 		 92 aa  48.9  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10601  predicted protein  31.43 
 
 		 105 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0359  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.89 
 
 		 89 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.128282  hitchhiker  0.00176843 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3604  Ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  35.29 
 
 		 93 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653493  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0274  ribonucleoprotein complex SRP, Srp19 component  29.55 
 
 		 113 aa  45.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0477  signal recognition particle, subunit SRP19 (srp19)  29.89 
 
 		 89 aa  45.1  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>