31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44346 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44346  predicted protein  100 
 
 
403 aa  841    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00014555  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  50.72 
 
 
611 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03220  conserved hypothetical protein  34.43 
 
 
534 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45011  predicted protein  40 
 
 
376 aa  50.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10760  RING finger protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10860)  35.48 
 
 
831 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45012  predicted protein  40.82 
 
 
437 aa  50.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.380882  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10792  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13310)  43.18 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47754  predicted protein  36.21 
 
 
407 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9668  predicted protein  42 
 
 
75 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00214643  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48146  predicted protein  38.78 
 
 
1348 aa  48.1  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49801  predicted protein  35.85 
 
 
632 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  51.16 
 
 
235 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46465  predicted protein  43.14 
 
 
401 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.814798  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26278  predicted protein  38.6 
 
 
103 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.063384 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27170  predicted protein  37.25 
 
 
59 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.839995 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28002  predicted protein  36.84 
 
 
222 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0279552 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29739  predicted protein  37.25 
 
 
59 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.462514  normal  0.0294486 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31341  predicted protein  32.14 
 
 
166 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000714962  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28766  predicted protein  38.3 
 
 
143 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0634822  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06049  RING finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09640)  40 
 
 
531 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04637  PA and RING finger domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02470)  30.56 
 
 
812 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.633588  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2849  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 
1160 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00446023  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47699  predicted protein  34.04 
 
 
231 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38024  predicted protein  36.17 
 
 
91 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0117252  normal  0.657933 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26734  predicted protein  34.62 
 
 
531 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191061  normal  0.915553 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00540  conserved hypothetical protein  39.58 
 
 
1025 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10707  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  36 
 
 
1415 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.671763 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84869  predicted protein  41.18 
 
 
437 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1118  predicted protein  28.1 
 
 
595 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03770  expressed protein  38.3 
 
 
433 aa  43.1  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  53.57 
 
 
883 aa  43.5  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>