222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43378 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43378  predicted protein  100 
 
 
1934 aa  3997  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 
1271 aa  94.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  31.02 
 
 
1130 aa  88.6  1e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  29.12 
 
 
1264 aa  85.5  9e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  3.02868e-06 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 
1298 aa  85.1  1e-14  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39392  predicted protein  24.07 
 
 
1324 aa  83.6  4e-14  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.93 
 
 
1441 aa  80.9  2e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 
1295 aa  79.3  6e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  25.19 
 
 
1123 aa  79.3  7e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.41 
 
 
1403 aa  77.4  3e-12  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.09 
 
 
1360 aa  77  3e-12  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  24.4 
 
 
1291 aa  73.9  2e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  26.52 
 
 
1093 aa  72.8  7e-11  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.5 
 
 
1663 aa  67.4  3e-09  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.31 
 
 
1089 aa  66.6  4e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
1429 aa  66.2  6e-09  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  26.14 
 
 
1811 aa  66.2  6e-09  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2978  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
1942 aa  66.2  6e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2252  adenylate/guanylate cyclase  20.65 
 
 
508 aa  65.9  8e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  27.31 
 
 
2017 aa  64.3  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  22.51 
 
 
1160 aa  63.5  4e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  38 
 
 
364 aa  63.2  5e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  24.03 
 
 
1153 aa  62.8  7e-08  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.38 
 
 
1422 aa  62.8  7e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  24.41 
 
 
1668 aa  62.4  8e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  25.4 
 
 
1046 aa  62  1e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  43.48 
 
 
699 aa  60.8  2e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  28.25 
 
 
1788 aa  61.2  2e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.16 
 
 
1081 aa  60.1  5e-07  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1908 aa  59.7  6e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  27.07 
 
 
388 aa  59.3  7e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.77 
 
 
1080 aa  58.9  1e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 
675 aa  58.5  1e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  39.33 
 
 
724 aa  57.8  2e-06  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  35.87 
 
 
399 aa  58.2  2e-06  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.38 
 
 
701 aa  57.8  2e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  37.97 
 
 
665 aa  57.8  2e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  25 
 
 
1836 aa  57.4  3e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6696  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.41 
 
 
1885 aa  57  4e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  24.21 
 
 
1037 aa  57  4e-06  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  37.5 
 
 
729 aa  56.6  4e-06  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  38.36 
 
 
681 aa  56.6  5e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  25 
 
 
1805 aa  56.2  5e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  21.52 
 
 
1398 aa  55.8  7e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  42.03 
 
 
416 aa  55.8  8e-06  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  40.58 
 
 
426 aa  55.8  8e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.04 
 
 
1226 aa  55.8  8e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1844  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.67 
 
 
725 aa  55.8  8e-06  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.266709 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  36.56 
 
 
401 aa  55.5  9e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  26.39 
 
 
1169 aa  55.5  9e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.87 
 
 
1805 aa  55.1  1e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  26.76 
 
 
381 aa  55.1  1e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  37.93 
 
 
348 aa  55.1  1e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  42.11 
 
 
597 aa  54.3  2e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.14 
 
 
1377 aa  54.7  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.25277e-08 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  26.6 
 
 
1808 aa  54.3  2e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 
401 aa  54.3  2e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  21.98 
 
 
1198 aa  54.3  2e-05  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  23.79 
 
 
348 aa  54.7  2e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  23.49 
 
 
735 aa  53.9  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  29.75 
 
 
1797 aa  53.9  3e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
420 aa  54.3  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
1744 aa  53.9  3e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  32.71 
 
 
593 aa  53.5  4e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  22.67 
 
 
2109 aa  53.5  4e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  21.39 
 
 
1141 aa  53.5  4e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.79 
 
 
2272 aa  53.5  4e-05  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.32 
 
 
852 aa  53.5  4e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  25.24 
 
 
1934 aa  53.1  5e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 
1027 aa  53.1  5e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 
1027 aa  53.1  5e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 
643 aa  53.1  5e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  41.67 
 
 
618 aa  52.8  6e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  26.15 
 
 
1712 aa  52.8  6e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.35 
 
 
1932 aa  53.1  6e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  25.6 
 
 
1027 aa  52.8  7e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  24.54 
 
 
2051 aa  52.4  9e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6425  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  35.56 
 
 
588 aa  52.4  9e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  26.94 
 
 
1922 aa  52.4  9e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  30.89 
 
 
1822 aa  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5515  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 
1302 aa  52  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.825294  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.73 
 
 
1780 aa  52  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.33 
 
 
611 aa  52  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  40.68 
 
 
670 aa  51.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  26.29 
 
 
712 aa  51.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.18563e-06  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  26.23 
 
 
1697 aa  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  21.94 
 
 
1148 aa  52  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
515 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.4 
 
 
1794 aa  51.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  33.82 
 
 
399 aa  51.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  40.68 
 
 
400 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.29 
 
 
1087 aa  50.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  21.53 
 
 
1134 aa  50.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
1096 aa  51.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.78 
 
 
966 aa  51.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  25.14 
 
 
1826 aa  50.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.06 
 
 
1055 aa  50.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4935  tetratricopeptide TPR_4  26.69 
 
 
1029 aa  50.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.27 
 
 
1285 aa  50.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  26.99 
 
 
483 aa  50.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  3.36338e-08  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>