36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42854 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42854  predicted protein  100 
 
 
768 aa  1600    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.652023  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48656  predicted protein  30.29 
 
 
404 aa  132  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46123  predicted protein  31.09 
 
 
434 aa  131  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48525  predicted protein  32.85 
 
 
417 aa  129  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50433  predicted protein  36.93 
 
 
331 aa  129  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45411  predicted protein  34.03 
 
 
406 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268289  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34299  predicted protein  45.87 
 
 
300 aa  103  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.203748 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10934  DHHC zinc finger membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16480)  36.54 
 
 
529 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.199799  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02740  vacuole protein, putative  30.41 
 
 
420 aa  100  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00800  vacuole protein, putative  48 
 
 
403 aa  96.3  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.714607  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84430  predicted protein  31.08 
 
 
400 aa  96.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01565  Palmitoyltransferase pfa4 (EC 2.3.1.-)(Protein fatty acyltransferase 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BD15]  31.52 
 
 
435 aa  95.9  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0604131  normal  0.184539 
 
 
-
 
NC_006686  CND06410  vacuole protein, putative  60 
 
 
644 aa  93.2  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04190  palmitoyltransferase, putative  37.17 
 
 
776 aa  90.1  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9699  predicted protein  60 
 
 
50 aa  84  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00227125  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18132  predicted protein  43.28 
 
 
377 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.29541  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  33.04 
 
 
737 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28008  predicted protein  35.34 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.133273 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32827  predicted protein  33.62 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15768  predicted protein  36.63 
 
 
187 aa  77.4  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34596  predicted protein  22.16 
 
 
399 aa  75.5  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.261571 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04763  DHHC zinc finger membrane protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06470)  30.83 
 
 
565 aa  75.1  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.165765  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04690  conserved hypothetical protein  29.03 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.573007  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90672  Heme Binding Zinc finger protein  33.94 
 
 
363 aa  74.3  0.000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.491736 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26089  predicted protein  37.19 
 
 
261 aa  72.8  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00734889 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04697  Palmitoyltransferase pfa5 (EC 2.3.1.-)(Protein fatty acyltransferase 5) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B433]  39.6 
 
 
486 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01907  Palmitoyltransferase swf1 (EC 2.3.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BC23]  54.55 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183278  normal  0.703803 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_1452  predicted protein  27.75 
 
 
493 aa  67.4  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0338335  normal  0.137357 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38073  predicted protein  45.83 
 
 
52 aa  62.4  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.683415  normal  0.745145 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46802  predicted protein  33.87 
 
 
579 aa  60.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10632  predicted protein  53.33 
 
 
53 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.233358  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_17764  predicted protein  24.34 
 
 
373 aa  57.8  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000195954  normal  0.0112396 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10631  predicted protein  44.68 
 
 
58 aa  57.4  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45173  predicted protein  26 
 
 
477 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42542  predicted protein  26.32 
 
 
304 aa  47.8  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03040  expressed protein  40 
 
 
471 aa  44.3  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>