123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42556 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42556  predicted protein  100 
 
 
964 aa  1989    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.162025  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50333  predicted protein  39.76 
 
 
619 aa  307  6e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1175  sulphate transporter  24.05 
 
 
730 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0317024  normal  0.332491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3069  hypothetical protein  26.96 
 
 
721 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2926  hypothetical protein  26.9 
 
 
721 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00680  vacuole protein, putative  23.08 
 
 
1177 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220987  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  26.33 
 
 
749 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1111  cyclic nucleotide-binding  22.02 
 
 
729 aa  124  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.804267  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03665  sulfate transporter family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G12440)  19.77 
 
 
1053 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85698  sulfate transporter Sulfate/bicarbonate/oxalate exchanger SAT-1 and related transporters (SLC26 family)  21.66 
 
 
963 aa  114  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.525688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  20.14 
 
 
739 aa  110  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0030  sulfate transporter  23.47 
 
 
734 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127752  normal  0.27039 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0635  putative sulfate permease with cyclic nucleotide-binding domain  24.37 
 
 
733 aa  101  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0466798  normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50075  predicted protein  20.82 
 
 
955 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0366  putative sulfate transporter  23.01 
 
 
727 aa  77  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.972082  normal  0.273026 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  22.61 
 
 
552 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  25 
 
 
626 aa  67  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  24.07 
 
 
563 aa  65.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  21.64 
 
 
575 aa  65.1  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  22.27 
 
 
730 aa  64.7  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0615  sulphate transporter  24.07 
 
 
540 aa  63.9  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1549  sulfate transporter  23.86 
 
 
552 aa  61.6  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0674996 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  19.17 
 
 
603 aa  59.7  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  23.89 
 
 
703 aa  59.3  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0104  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  22.62 
 
 
565 aa  58.9  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  21.3 
 
 
606 aa  58.2  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1459  SulP family sulfate permease  22.14 
 
 
551 aa  57.8  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.032999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  19.85 
 
 
599 aa  57.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4088  sulphate transporter  23.32 
 
 
558 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.242606  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1943  sulfate permease family protein  28.48 
 
 
579 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2051  sulphate transporter  28.48 
 
 
579 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.78423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1731  SulP family sulfate permease  22.64 
 
 
551 aa  57  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.281721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3236  sulphate transporter  25.51 
 
 
562 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  22.51 
 
 
570 aa  56.2  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  21.36 
 
 
580 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1078  sulfate transporter  22.94 
 
 
552 aa  55.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.408762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  22.27 
 
 
583 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  20.51 
 
 
573 aa  55.5  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1342  cyclic nucleotide-binding  22.22 
 
 
731 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0631571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0825  sulphate transporter  24.48 
 
 
531 aa  55.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.270295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  23.02 
 
 
572 aa  55.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2257  sulphate transporter  23.77 
 
 
572 aa  55.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00522526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2371  sulphate transporter  22.52 
 
 
604 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  22.41 
 
 
563 aa  54.3  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3320  putative sulfate transporter YchM  23.53 
 
 
573 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232868  hitchhiker  0.00197509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0891  putative sulfate transporter  25.63 
 
 
565 aa  53.5  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1734  sulphate transporter  22.06 
 
 
581 aa  53.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181286  normal  0.0512367 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3904  cyclic nucleotide-binding:Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  22.47 
 
 
736 aa  53.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  22.44 
 
 
579 aa  52.8  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  22.61 
 
 
583 aa  53.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  23.37 
 
 
572 aa  53.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0985  putative sulfate transporter  24.5 
 
 
549 aa  52.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  24.66 
 
 
590 aa  52.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  20.24 
 
 
578 aa  51.6  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1650  sulphate transporter  22.64 
 
 
511 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  25.29 
 
 
568 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1867  sulphate transporter  27.86 
 
 
557 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  26.71 
 
 
578 aa  50.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  22.64 
 
 
729 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2506  sulfate permease  22.74 
 
 
581 aa  50.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0765  sulphate transporter  24.59 
 
 
573 aa  50.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.284221  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  25.29 
 
 
568 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0840  sulfate transporter  22.52 
 
 
559 aa  50.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  21.58 
 
 
703 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  20.43 
 
 
603 aa  49.3  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4452  sulphate transporter  21.69 
 
 
512 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248248  normal  0.0871975 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  24 
 
 
560 aa  49.7  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  22.17 
 
 
567 aa  48.9  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1080  sulphate transporter  23.49 
 
 
540 aa  49.3  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.610745  normal  0.0982504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  26.01 
 
 
568 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  20.05 
 
 
570 aa  48.9  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3387  sulphate transporter  25.38 
 
 
564 aa  48.9  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.084852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  25.45 
 
 
749 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3250  sulphate transporter  25.88 
 
 
569 aa  48.5  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.338043  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03009  hypothetical protein  21.02 
 
 
520 aa  48.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0754  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  24.66 
 
 
573 aa  48.1  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0119  sulfate permease family protein  22.12 
 
 
548 aa  48.5  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  20.92 
 
 
588 aa  48.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  28.26 
 
 
558 aa  47.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  25.26 
 
 
556 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2681  sulphate transporter  23.1 
 
 
504 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.529175 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  20.97 
 
 
568 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02331  putative sulfate transporter  24.54 
 
 
550 aa  47.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.868992  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0036  sulfate permease family protein  26.58 
 
 
592 aa  47.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  22 
 
 
573 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4387  sulphate transporter  23.8 
 
 
519 aa  47.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  21.85 
 
 
594 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  22.31 
 
 
586 aa  46.6  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3333  carbonate dehydratase  24.43 
 
 
783 aa  47  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4228  sulphate transporter  21.5 
 
 
536 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2676  sulphate transporter  26.88 
 
 
567 aa  47  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.143295  hitchhiker  0.000143719 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4804  sulphate transporter  20.96 
 
 
583 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  21.89 
 
 
567 aa  46.2  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1831  putative sulfate transporter  23.42 
 
 
560 aa  46.2  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.505905  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0216  putative sulfate transporter  24.23 
 
 
550 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1878  sulphate transporter  22.98 
 
 
572 aa  46.2  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.536686  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02441  putative sulfate transporter  24.39 
 
 
551 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0624614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1838  sulphate transporter  20.96 
 
 
509 aa  46.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02341  putative sulfate transporter  22.49 
 
 
577 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0405  sulphate transporter  22.22 
 
 
560 aa  46.2  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>