176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42481 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42481  predicted protein  100 
 
 
332 aa  694    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00503465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9195  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 
296 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2350  hypothetical protein  21.6 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000109829  hitchhiker  0.000000775471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.91 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  23.78 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.91 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 
262 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
474 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  32.69 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 
309 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
290 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
335 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 
356 aa  50.4  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
602 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.13 
 
 
290 aa  49.7  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
504 aa  49.3  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
291 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.73 
 
 
302 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  25.15 
 
 
270 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.81 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  24.32 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  25.95 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0578  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
336 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  28.57 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  23.08 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
301 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.83 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  26.32 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0551  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0555  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  23.12 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  26.67 
 
 
194 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 
268 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
312 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  22.51 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  23.58 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  23.89 
 
 
323 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
288 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
290 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
264 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
287 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
300 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  24.17 
 
 
284 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
265 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
351 aa  46.2  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 
256 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  23.93 
 
 
283 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 
289 aa  46.2  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 
256 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
288 aa  46.2  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.25 
 
 
293 aa  45.8  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
289 aa  46.2  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  22.66 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  23.79 
 
 
252 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  32.67 
 
 
590 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
291 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  27.52 
 
 
300 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  27.33 
 
 
301 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
311 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  31.9 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  22.64 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 
289 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0564  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
461 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11147  epoxide hydrolase ephC  30.07 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
274 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>