206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42439 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42439  predicted protein  100 
 
 		 570 aa  1184    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00659721  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9252  predicted protein  62.84 
 
 		 261 aa  346  5e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00301456  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  33.14 
 
 		 669 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15482  predicted protein  40.23 
 
 		 253 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39588  Rhomboid-related protein 1 (RRP) (Rhomboid-like protein 1)  25.64 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0102742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03630  conserved hypothetical protein  29.44 
 
 		 422 aa  87.4  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  32.07 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  36.02 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  30.95 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  32.74 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  32.74 
 
 		 487 aa  82.8  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  28.25 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  31.87 
 
 		 342 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  35 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1208  rhomboid family protein  35.16 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102271  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  31.29 
 
 		 486 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  41.18 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48028  predicted protein  25.74 
 
 		 522 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  32.34 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0227  rhomboid family protein  29.68 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  31.95 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  34 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  34 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_5543  predicted protein  28.87 
 
 		 141 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0202221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  32.42 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10929  rhomboid family membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16490)  32.67 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  30.82 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  31.75 
 
 		 371 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  29.22 
 
 		 554 aa  73.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  31.01 
 
 		 389 aa  72  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  33.53 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  32.28 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  32.24 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  28.96 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  28.37 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  41.11 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0235  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 190 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0221  rhomboid-like protein  31.08 
 
 		 190 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0260  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 190 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0249  rhomboid family protein  31.08 
 
 		 190 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  30.43 
 
 		 327 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0223  rhomboid-like protein  31.76 
 
 		 190 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  33.72 
 
 		 271 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47107  predicted protein  32.65 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432891  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  30.95 
 
 		 511 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0621  Rhomboid family protein  27.51 
 
 		 359 aa  66.6  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.273052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  36.11 
 
 		 579 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  33.78 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  30.56 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  33.55 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0283  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 190 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0269  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1097  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2212  Rhomboid family protein  34.55 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00605445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0235  rhomboid family protein  37.8 
 
 		 186 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  31.28 
 
 		 348 aa  62.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  29.66 
 
 		 263 aa  62.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  29.28 
 
 		 284 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  30.73 
 
 		 376 aa  62  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  29.17 
 
 		 547 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  35.29 
 
 		 625 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0058  Rhomboid family protein  35.16 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  26.51 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  34.15 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0013  rhomboid family protein  35.37 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  30.63 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  28.5 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  26.75 
 
 		 523 aa  57.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3651  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 747 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.015996 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  31.29 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5574  Rhomboid family protein  30.46 
 
 		 228 aa  57  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  26.17 
 
 		 528 aa  56.6  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0044  Rhomboid family protein  25.85 
 
 		 356 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0264  rhomboid family protein  35.48 
 
 		 190 aa  57  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.886981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0982  rhomboid family protein  29.38 
 
 		 283 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  32.21 
 
 		 381 aa  56.6  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0591  peptidase, S54 (rhomboid) family  35.29 
 
 		 625 aa  56.6  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  34.31 
 
 		 625 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  31.45 
 
 		 281 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0404  rhomboid family protein  36.9 
 
 		 225 aa  55.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4443  rhomboid-like protein  37.08 
 
 		 275 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.6785  normal  0.502259 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  34.31 
 
 		 625 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.31 
 
 		 625 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5062  rhomboid family protein  36.56 
 
 		 190 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2170  rhomboid family protein  25.66 
 
 		 183 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000411867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  29.59 
 
 		 280 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 281 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  30.82 
 
 		 281 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  29.19 
 
 		 289 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  29.52 
 
 		 228 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  28.19 
 
 		 281 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  29.19 
 
 		 289 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  29.19 
 
 		 289 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  30.21 
 
 		 515 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  31.4 
 
 		 291 aa  54.3  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  37.18 
 
 		 283 aa  54.3  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 281 aa  54.3  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>