More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42307 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_42307  predicted protein  100 
 
 		 453 aa  920    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000154334  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32338  predicted protein  66.81 
 
 		 463 aa  607  9.999999999999999e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207682  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04470  hypothetical protein similar to translation initiation factor 2 gamma subunit (Broad)  64.85 
 
 		 514 aa  597  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.972287  normal  0.290291 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83918  predicted protein  63.46 
 
 		 522 aa  581  1.0000000000000001e-165  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.652137  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01480  eukaryotic translation initiation factor 2 gamma, putative  58.57 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0523  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  45.65 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0382  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.9 
 
 		 410 aa  364  1e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1464  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.9 
 
 		 410 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0455  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.9 
 
 		 410 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0563  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.52 
 
 		 423 aa  352  8e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0803  protein synthesis factor GTP-binding protein  43.8 
 
 		 408 aa  344  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0287  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.68 
 
 		 426 aa  342  7e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1319  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  44.72 
 
 		 409 aa  339  5e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.472649  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0246  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.09 
 
 		 410 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0605  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.35 
 
 		 411 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0660  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.82 
 
 		 411 aa  331  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2240  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.07 
 
 		 411 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1389  protein synthesis factor GTP-binding protein  41.26 
 
 		 415 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2861  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.23 
 
 		 411 aa  327  3e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00223054  normal  0.810551 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0247  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.51 
 
 		 403 aa  326  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2243  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.16 
 
 		 415 aa  322  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.241915  hitchhiker  0.0027626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2278  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.44 
 
 		 408 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000943916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2398  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.07 
 
 		 412 aa  319  7.999999999999999e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0072  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.75 
 
 		 420 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3452  protein synthesis factor GTP-binding protein  41.95 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2209  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  42.65 
 
 		 411 aa  304  3.0000000000000004e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.211822  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1486  protein synthesis factor GTP-binding protein  41.89 
 
 		 409 aa  303  5.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.848382  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1171  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  40.53 
 
 		 411 aa  298  1e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.568284  normal  0.119689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1531  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  41.81 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0730  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  43.8 
 
 		 410 aa  296  4e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0078  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39.08 
 
 		 411 aa  286  5e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0695482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1010  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  39 
 
 		 411 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000495902 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0242  translation initiation factor IF-2 subunit gamma  38.69 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1647  selenocysteine-specific translation elongation factor  37.45 
 
 		 644 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00236334  hitchhiker  0.000000010303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2503  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  35.51 
 
 		 634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00650537  normal  0.143065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2506  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.31 
 
 		 650 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1094  selenocysteine-specific translation elongation factor  32 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0762  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.89 
 
 		 634 aa  122  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.97012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3567  selenocysteine-specific translation elongation factor  35 
 
 		 636 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2441  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.32 
 
 		 642 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04538  elongation factor Tu  29.52 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04524  elongation factor Tu  29.52 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00165696  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0673  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.31 
 
 		 635 aa  117  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf525  elongation factor Tu  27.34 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3415  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  33.19 
 
 		 636 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1385  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.91 
 
 		 619 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0034  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.04 
 
 		 636 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1123  selenocysteine-specific translation elongation factor  34.03 
 
 		 627 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0102  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.19 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  28.3 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  28.3 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0769  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.76 
 
 		 629 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.709604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  28.37 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3173  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  32.07 
 
 		 644 aa  110  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  28.2 
 
 		 402 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1220  selenocysteine-specific translation elongation factor  31 
 
 		 642 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00584658  normal  0.153868 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  31.97 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  31.97 
 
 		 396 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  33.33 
 
 		 396 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2869  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.62 
 
 		 655 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0571166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  33.33 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0035  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.62 
 
 		 636 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2203  elongation factor Tu  29.04 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000805833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2191  elongation factor Tu  29.04 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2086  selenocysteine-specific translation elongation factor  31.51 
 
 		 657 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0347898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2185  selenocysteine-specific translation elongation factor  29.54 
 
 		 635 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.573253  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2114  elongation factor Tu  29.04 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  28.2 
 
 		 402 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2101  elongation factor Tu  29.04 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.235673  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  32.38 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1810  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  30.8 
 
 		 627 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  28.21 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  28.21 
 
 		 396 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  31.2 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  31.2 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  28.44 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  28.44 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  28.44 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  31.76 
 
 		 395 aa  107  6e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3485  selenocysteine-specific translation elongation factor  32.27 
 
 		 643 aa  107  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.035122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  32.58 
 
 		 394 aa  106  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3021  elongation factor Tu  31.84 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000542381  hitchhiker  0.00818484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3041  elongation factor Tu  31.84 
 
 		 396 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0080343  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5596  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.36 
 
 		 570 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.436165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5216  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.36 
 
 		 565 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5304  selenocysteine-specific translation elongation factor SelB  36.36 
 
 		 565 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0164  selenocysteine-specific translation elongation factor  33.19 
 
 		 636 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  26.46 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  28.6 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  28.61 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  28.61 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  28.07 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  28.07 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  27.05 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  31.74 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  31.74 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  32.07 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2825  selenocysteine-specific translation elongation factor  27.76 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.518854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  28.16 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4449  elongation factor Tu  28.57 
 
 		 396 aa  104  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000257017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>