62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41570 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_41570  precursor of desaturase omega-3 desaturase  100 
 
 
435 aa  904    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.692269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4210  Fatty acid desaturase  27.87 
 
 
359 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762153  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24150  predicted protein  31.03 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3556  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  30.25 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.528464  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3182  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  29.34 
 
 
360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51246  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18582  predicted protein  27.63 
 
 
362 aa  109  9.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.432671  hitchhiker  0.00624094 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48423  precursor of desaturase omega-6 desaturase  27.18 
 
 
495 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15601  fatty acid desaturase, type 2  27.76 
 
 
375 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4492  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.97 
 
 
357 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.829134  normal  0.772005 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1476  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.03 
 
 
391 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265666  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01037  Oleate delta-12 desaturase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HF05]  26.32 
 
 
471 aa  104  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.334758 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72518  oleate delta-12 desaturase  26.84 
 
 
418 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21081  fatty acid desaturase, type 2  27.38 
 
 
380 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.250719 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81126  predicted protein  28.15 
 
 
435 aa  99.8  8e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000271264 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15761  fatty acid desaturase, type 2  26.73 
 
 
388 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0393  delta(12)-fatty acid dehydrogenase  27.03 
 
 
405 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0147446  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15921  fatty acid desaturase, type 2  27.33 
 
 
344 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.430408  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10821  Fatty acid desaturase  26.82 
 
 
405 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.948935  hitchhiker  0.00588029 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07204  bifunctional oelate/linoleic acid delta desaturase (Eurofung)  26.3 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.710425 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1972  Delta(12)-fatty acid dehydrogenase  28.32 
 
 
381 aa  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.662078  normal  0.276808 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25769  delta 12 fatty acid desaturase  27.09 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02750  Delta-12 fatty acid desaturase, putative  27.93 
 
 
448 aa  89.7  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2805  fatty acid desaturase  24.43 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3295  fatty acid desaturase  24.14 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.656567  normal  0.895911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4259  fatty acid desaturase  26.03 
 
 
349 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1774  fatty acid desaturase  28.9 
 
 
349 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3555  fatty acid desaturase  26.25 
 
 
352 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.362287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2792  fatty acid desaturase  26.29 
 
 
343 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2998  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
343 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000179604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2737  delta5 acyl-lipid desaturase  27.27 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2788  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
319 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.113253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3000  fatty acid desaturase  27.27 
 
 
319 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00130141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2718  delta5 acyl-lipid desaturase  26.19 
 
 
343 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.645023  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06461  hypothetical protein  37.63 
 
 
141 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4211  Fatty acid desaturase  26.52 
 
 
350 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3034  fatty acid desaturase  25.79 
 
 
343 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3000  fatty acid desaturase  25.5 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2242  fatty acid desaturase  25.38 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122281  hitchhiker  0.0000471341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0399  fatty acid desaturase  26 
 
 
349 aa  58.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2541  fatty acid desaturase  23.22 
 
 
349 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06471  hypothetical protein  24.82 
 
 
180 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.301635 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3036  fatty acid desaturase  25.4 
 
 
343 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4601  fatty acid desaturase  24.44 
 
 
354 aa  57  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.845504  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0142  fatty acid desaturase  24.61 
 
 
351 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5461  fatty acid desaturase  25.68 
 
 
376 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  0.189601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3000  putative fatty acid desaturase  26.78 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2879  fatty acid desaturase  22.87 
 
 
376 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1632  fatty acid desaturase  22.26 
 
 
374 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000412854  decreased coverage  0.00000000182174 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1964  fatty acid desaturase  22.26 
 
 
374 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1170  fatty acid desaturase  25.46 
 
 
376 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0032  fatty acid desaturase  24.54 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.925733  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1784  fatty acid desaturase domain-containing protein  25.46 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3764  fatty acid desaturase  23.24 
 
 
351 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.393877  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0028  fatty acid desaturase  24.16 
 
 
344 aa  47  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00913756  hitchhiker  0.0000248871 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0141  fatty acid desaturase  24.75 
 
 
333 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1793  fatty acid desaturase  25.55 
 
 
357 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.522946  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2995  fatty acid desaturase  24.82 
 
 
348 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.759624  normal  0.309972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2986  fatty acid desaturase  24.91 
 
 
358 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2594  fatty acid desaturase  21.89 
 
 
335 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  0.0739489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3282  fatty acid desaturase  24.01 
 
 
328 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.10272  normal  0.329642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2837  fatty acid desaturase domain-containing protein  22.99 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2718  fatty acid desaturase family protein  22.99 
 
 
426 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>