159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41496 on replicon NC_011698
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011698  PHATRDRAFT_41496  predicted protein  100 
 
 
137 aa  283  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28585  predicted protein  93.89 
 
 
326 aa  256  6e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.663104  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00385  branched-chain amino-acid transaminase, putative (Eurofung)  44.55 
 
 
394 aa  85.9  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31397  predicted protein  43.12 
 
 
336 aa  85.5  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.635842  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1409  branched-chain amino acid aminotransferase  37.74 
 
 
340 aa  84.7  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2743  branched-chain amino acid aminotransferase  39.42 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646855  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32849  predicted protein  44 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.163487  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0494  branched-chain amino acid aminotransferase  38.68 
 
 
339 aa  82.4  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0962388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3467  branched-chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
339 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1319  branched-chain amino acid aminotransferase  38.32 
 
 
347 aa  80.9  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.724112  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0259  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
354 aa  80.5  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581012  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1332  branched-chain amino acid aminotransferase  34.62 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1148  branched-chain amino acid aminotransferase  34.62 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0047  branched-chain amino acid aminotransferase  43.56 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1296  branched-chain amino acid aminotransferase  35.51 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.181598  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1152  branched-chain amino acid aminotransferase  35.85 
 
 
340 aa  79  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000440296  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50793  predicted protein  37.89 
 
 
409 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.141082  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1772  branched-chain amino acid aminotransferase  34.62 
 
 
341 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0397129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1501  branched-chain amino acid aminotransferase  34.62 
 
 
341 aa  77.4  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.211929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3511  branched-chain amino acid aminotransferase  35.58 
 
 
339 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137347  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2264  branched-chain amino acid aminotransferase  35.58 
 
 
339 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2417  branched-chain amino acid aminotransferase  35.58 
 
 
339 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.204279  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2410  branched-chain amino acid aminotransferase  35.58 
 
 
339 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428116  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12950  branched-chain amino acid aminotransferase  36.79 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.765699  normal  0.148306 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0635  branched-chain amino acid aminotransferase  33.96 
 
 
340 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000185267  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08670  branched-chain amino acid aminotransferase  36.79 
 
 
345 aa  73.6  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00341409  normal  0.322346 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3308  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3370  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0514803  normal  0.142913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3319  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0933798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6535  branched-chain amino acid aminotransferase  37.86 
 
 
372 aa  70.9  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3577  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2940  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3428  branched-chain amino acid aminotransferase  32.52 
 
 
353 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.82358  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3509  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
353 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1071  branched-chain amino acid aminotransferase  33.64 
 
 
348 aa  68.6  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2811  branched-chain amino acid aminotransferase  38.38 
 
 
363 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.642497  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2487  branched-chain amino acid aminotransferase  36.27 
 
 
366 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08600  branched chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
363 aa  68.2  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2529  branched chain amino acid aminotransferase  37.37 
 
 
370 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00227274  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07876  branched-chain amino-acid transaminase, putative (Eurofung)  35.64 
 
 
348 aa  67.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1524  branched-chain amino acid aminotransferase  30.33 
 
 
367 aa  67.8  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2742  branched-chain amino acid aminotransferase  36.27 
 
 
366 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3573  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
367 aa  67.4  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0805126  normal  0.118426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0176  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 
371 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.473738 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1393  Branched-chain amino acid aminotransferase/4-amino-4-deoxychorismate lyase protein  35.64 
 
 
367 aa  67  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2638  branched-chain amino acid aminotransferase  34.65 
 
 
359 aa  67  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000340961  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7786  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 
365 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09890  branched chain amino acid aminotransferase  33.98 
 
 
373 aa  65.5  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.03528 
 
 
-
 
NC_002950  PG1290  branched-chain amino acid aminotransferase  34.74 
 
 
339 aa  65.5  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1356  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
367 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1877  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 
356 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.335464  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2671  branched-chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
367 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2817  branched chain amino acid aminotransferase  32 
 
 
358 aa  65.1  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.218798  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0889  branched chain amino acid aminotransferase  31 
 
 
355 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3098  branched-chain amino acid aminotransferase  37 
 
 
357 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.409471 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0726  branched-chain amino acid aminotransferase  36.89 
 
 
364 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.275399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0616  branched-chain amino acid aminotransferase  36.36 
 
 
373 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00980  hypothetical protein  34.65 
 
 
437 aa  64.3  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1604  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 
368 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.591229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5588  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
362 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0289083  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0778  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
359 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3951  branched-chain amino acid aminotransferase  32.67 
 
 
357 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000422235  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4282  branched-chain amino acid aminotransferase  37 
 
 
364 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2853  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
357 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000542483  hitchhiker  0.0000000111677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2919  branched chain amino acid aminotransferase  36.54 
 
 
366 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.742816  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3957  branched-chain amino acid aminotransferase  35.85 
 
 
379 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1327  branched-chain amino acid aminotransferase  32.67 
 
 
354 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1358  branched-chain amino acid aminotransferase  32.67 
 
 
354 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4219  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
366 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2588  branched-chain amino acid aminotransferase  28.93 
 
 
354 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000807633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18760  branched chain amino acid aminotransferase  34.17 
 
 
363 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.103024  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4107  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
366 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2382  branched-chain amino acid aminotransferase  37.62 
 
 
377 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3367  branched chain amino acid aminotransferase  35.64 
 
 
357 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2596  branched-chain amino acid aminotransferase  31.63 
 
 
362 aa  62.4  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0856  branched chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 
356 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2267  branched-chain amino acid aminotransferase  35.35 
 
 
370 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097897 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1098  branched-chain amino acid aminotransferase  30.61 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0823676  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3543  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
367 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0537  branched-chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 
356 aa  62  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0572  branched-chain amino acid aminotransferase  31.68 
 
 
356 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000149445  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1240  branched-chain amino acid aminotransferase  31.68 
 
 
365 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8041  branched-chain amino acid aminotransferase  36.27 
 
 
364 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0195  branched-chain amino acid aminotransferase  31.31 
 
 
358 aa  59.7  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4175  branched-chain amino acid aminotransferase  35 
 
 
371 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121006  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  29.03 
 
 
350 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5661  branched-chain amino acid aminotransferase  34.34 
 
 
365 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3725  branched-chain amino acid aminotransferase  34.34 
 
 
365 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.20757  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4643  branched-chain amino acid aminotransferase  34.34 
 
 
365 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4770  branched-chain amino acid aminotransferase  26.6 
 
 
356 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.46098  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12238  branched-chain amino acid aminotransferase  29.7 
 
 
368 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0127743  normal  0.533205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1703  branched-chain amino acid aminotransferase  36.63 
 
 
375 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0434544 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0585  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 
356 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00279686 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2663  branched-chain amino acid aminotransferase  30.3 
 
 
353 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.741695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3886  branched-chain amino acid aminotransferase  33.66 
 
 
370 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184711  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6410  branched-chain amino acid aminotransferase  28.29 
 
 
374 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.569805  normal  0.545027 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0747  branched-chain amino acid aminotransferase  27.87 
 
 
368 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.031248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2520  branched-chain amino acid aminotransferase  33.33 
 
 
370 aa  57.8  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.11259 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0656  branched-chain amino acid aminotransferase  32.35 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0622258  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1388  branched-chain amino acid aminotransferase  35.29 
 
 
370 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632887  normal  0.497435 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>