40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41316 on replicon NC_011697
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011697  PHATRDRAFT_41316  predicted protein  100 
 
 		 380 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1191 aa  99.4  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  21.75 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  19.14 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  19.14 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  18.1 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  30.22 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  20.44 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  21.1 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  22.19 
 
 		 14916 aa  64.7  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  18.97 
 
 		 517 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  20.91 
 
 		 862 aa  60.1  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  22.25 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  23.91 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  18.34 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  23.15 
 
 		 312 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  18.01 
 
 		 483 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  22.97 
 
 		 277 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  24.26 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  22.8 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 		 381 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  25.86 
 
 		 233 aa  52.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  23.08 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  21.47 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  17.7 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5651  exported repetitive protein precursor PirG (cell surface protein) (EXP53)  36.51 
 
 		 320 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2907  hypothetical protein  21.93 
 
 		 625 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  37.86 
 
 		 1421 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11947  PPE family protein  31.22 
 
 		 1013 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  21.98 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1158  repeat of unknown function XGLTT  38.1 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.04272  normal  0.133986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  24.35 
 
 		 142 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  26.21 
 
 		 152 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  25.56 
 
 		 151 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  22.55 
 
 		 3521 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  20.53 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5996  hypothetical protein  37.06 
 
 		 455 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0958307  normal  0.0425607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  21.88 
 
 		 267 aa  43.1  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0690  hypothetical protein  37.14 
 
 		 639 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  22.87 
 
 		 1787 aa  43.1  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>