220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41268 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_41268  predicted protein  100 
 
 
491 aa  999    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.577371  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  36.11 
 
 
454 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
458 aa  59.7  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
404 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
300 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 
307 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  34.55 
 
 
816 aa  56.6  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  37.27 
 
 
300 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 
680 aa  56.6  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  32.09 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
594 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
438 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.592748 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3785  histidine kinase  35.92 
 
 
438 aa  53.9  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 
437 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
920 aa  53.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.94 
 
 
442 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
591 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  33.33 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2257  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1162 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
803 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.623752 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  36.76 
 
 
374 aa  50.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1283  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
632 aa  50.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000223104  hitchhiker  0.0000247295 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1885  sensor protein KdpD  33.71 
 
 
913 aa  50.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.899073  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.57 
 
 
465 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5325  sensor histidine kinase  37.84 
 
 
444 aa  50.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
797 aa  50.4  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  38.46 
 
 
471 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  31.82 
 
 
816 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  37.14 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
494 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
361 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.54 
 
 
494 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  40.54 
 
 
494 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
502 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  30.77 
 
 
502 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02109  transmembrane two-component sensor kinase transcription regulator protein  38.03 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620741  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.26 
 
 
549 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
560 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  33.64 
 
 
593 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 
1195 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2365  histidine kinase  28.47 
 
 
435 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
457 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
463 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0406486  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2082  histidine kinase  30.58 
 
 
714 aa  48.5  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  34 
 
 
588 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  38.03 
 
 
270 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1080 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.836598  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
542 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
756 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
494 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  33.63 
 
 
1355 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0517  ATPase domain-containing protein  33.9 
 
 
432 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.907108  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
1301 aa  47.4  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
493 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  27.93 
 
 
486 aa  47.4  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.687103 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3637  two-component sensor KdpD  38.75 
 
 
885 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  27.03 
 
 
487 aa  47.4  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
981 aa  47  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  25.45 
 
 
391 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
579 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  25.45 
 
 
391 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
494 aa  47  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2877  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
463 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.609757  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01127  sensory histidine kinase in two-compoent regulatory system with PhoP  27.93 
 
 
486 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2518  histidine kinase  27.93 
 
 
486 aa  47  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.208145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1292  sensor protein PhoQ  27.93 
 
 
486 aa  47  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.71 
 
 
631 aa  47  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1590  sensor protein PhoQ  27.93 
 
 
486 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000452252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1307  sensor protein PhoQ  27.93 
 
 
486 aa  47  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  35 
 
 
373 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2258  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 
528 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01135  hypothetical protein  27.93 
 
 
486 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0813  histidine kinase  26.61 
 
 
587 aa  47  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  34.48 
 
 
914 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0877  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
1050 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.948624  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1954  sensor protein PhoQ  26.27 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1331  sensor protein PhoQ  26.27 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0246748  normal  0.298422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  30 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
883 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
887 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
602 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0674  sensor histidine kinase  30 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  34.25 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
498 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  26.27 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.062219 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24520  osmosensory K+channel histidine protein kinase, KdpD  33.33 
 
 
874 aa  46.2  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.889371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4050  adaptive-response sensory kinase  28.43 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.588748  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  30 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1309  sensor protein PhoQ  26.27 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  26.27 
 
 
487 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  30 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
887 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  30 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  30 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  30 
 
 
438 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>