21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41220 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_41220  predicted protein  100 
 
 
420 aa  867    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.132681  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0639  protein of unknown function DUF1350  29.39 
 
 
255 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0137966  normal  0.966609 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33610  predicted protein  28.37 
 
 
351 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0565189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3724  hypothetical protein  28.38 
 
 
255 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.213195  normal  0.56109 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26924  predicted protein  27.57 
 
 
437 aa  87  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0912  hypothetical protein  29.39 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2565  protein of unknown function DUF1350  28.51 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.614783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3548  protein of unknown function DUF1350  28.51 
 
 
261 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1317  hypothetical protein  29.75 
 
 
241 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1140  hypothetical protein  29.83 
 
 
242 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1022  hypothetical protein  26.1 
 
 
262 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19001  hypothetical protein  27.01 
 
 
242 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.678981 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0175  hypothetical protein  26.82 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4501  protein of unknown function DUF1350  28.51 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.468214 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06761  hypothetical protein  28.12 
 
 
240 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07251  hypothetical protein  30.17 
 
 
242 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.162957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06461  hypothetical protein  27.68 
 
 
240 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06851  hypothetical protein  27.23 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330467  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0620  hypothetical protein  26.34 
 
 
240 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06791  hypothetical protein  25.09 
 
 
244 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.753898  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0058  hypothetical protein  24.36 
 
 
244 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.239306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>