17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41170 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_41170  predicted protein  100 
 
 
531 aa  1090    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989203  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_10319  predicted protein  53.66 
 
 
240 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0970285  normal  0.563011 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5300  predicted protein  46.26 
 
 
245 aa  188  2e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.025079 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1055  alternative oxidase  49.25 
 
 
228 aa  176  9e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000214827  hitchhiker  0.0000989196 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48063  predicted protein  41.75 
 
 
314 aa  163  7e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3824  alternative oxidase  47.1 
 
 
164 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0341  plastoquinol terminal oxidase  35.88 
 
 
169 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.277464  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03641  hypothetical protein  35.25 
 
 
169 aa  97.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03651  hypothetical protein  35.07 
 
 
169 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.641535  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11341  hypothetical protein  38.89 
 
 
167 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502236 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0429  plastoquinol terminal oxidase  38.89 
 
 
167 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01500  alternative oxidase 1  29.44 
 
 
401 aa  60.1  0.00000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0439  plastoquinol terminal oxidase  28.41 
 
 
207 aa  56.6  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0881752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1660  Alternative oxidase  31.21 
 
 
209 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67332  Alternative oxidase, mitochondrial precursor (SHAM-sensitive terminal oxidase) (STO1)  30.3 
 
 
357 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.537821  normal  0.0955633 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02099  Alternative oxidase, mitochondrial Precursor (EC 1.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9P959]  29.32 
 
 
354 aa  43.9  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.168616  normal  0.300538 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3395  alternative oxidase  27.15 
 
 
211 aa  43.9  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.684782  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>