More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41167 on replicon NC_011696
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011696  PHATRDRAFT_41167  predicted protein  100 
 
 		 1469 aa  3035    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34459  predicted protein  34.29 
 
 		 936 aa  379  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.318695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_193  predicted protein  34.86 
 
 		 811 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0944524 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02138  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16140)  35.39 
 
 		 1288 aa  353  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.55814  normal  0.230304 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05350  ATP-dependent RNA helicase A, putative  34.38 
 
 		 1325 aa  341  5e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0937358  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81358  predicted protein  29.38 
 
 		 1407 aa  331  8e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.558576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40777  predicted protein  31.18 
 
 		 1041 aa  308  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.105626  normal  0.0398224 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54577  helicase_2  30.31 
 
 		 790 aa  302  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.510573  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05839  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07950)  33.72 
 
 		 1436 aa  295  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119781  Dhx57-like DEXH-box helicase, probable  30.66 
 
 		 1545 aa  266  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_42076  predicted protein  38.13 
 
 		 528 aa  259  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01980  conserved hypothetical protein  28.91 
 
 		 1581 aa  255  5.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03560  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 1450 aa  244  7e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00609757  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38697  predicted protein  34.72 
 
 		 713 aa  221  6e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42421  predicted protein  26.99 
 
 		 989 aa  219  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0589659  normal  0.298974 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87921  RNA helicase involved in spliceosome disassembly  30.45 
 
 		 771 aa  212  6e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.155834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16270  ATP-dependent DEAH box helicase HrpA  28.31 
 
 		 1374 aa  201  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03920  pre-mRNA splicing factor, putative  31.22 
 
 		 783 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21400  putative ATP-dependent helicase  33.33 
 
 		 1326 aa  198  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02501  ATP-dependent RNA helicase HrpA  32.84 
 
 		 1345 aa  197  9e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1511  ATP-dependent helicase HrpA  33.12 
 
 		 1338 aa  197  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.282156  normal  0.513944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16740  ATP-dependent helicase HrpA  30.76 
 
 		 1331 aa  197  1e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.035115  normal  0.334813 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01640  pre-mRNA splicing factor, putative  29.01 
 
 		 699 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003548  ATP-dependent helicase HrpA  31.77 
 
 		 1328 aa  196  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.966108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2963  ATP-dependent helicase HrpA  33.47 
 
 		 1309 aa  197  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1827  ATP-dependent helicase HrpA  33.12 
 
 		 1326 aa  196  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4095  ATP-dependent helicase HrpA  32.06 
 
 		 1303 aa  196  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0267  ATP-dependent helicase HrpA  32.63 
 
 		 1312 aa  195  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0507  ATP-dependent helicase HrpA  28.7 
 
 		 1349 aa  194  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3831  ATP-dependent helicase HrpA  31.85 
 
 		 1303 aa  194  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1420  ATP-dependent helicase HrpA  31.85 
 
 		 1303 aa  194  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170977  normal  0.854242 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2399  ATP-dependent helicase HrpA  32.57 
 
 		 1402 aa  192  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5766  ATP-dependent helicase HrpA  30.63 
 
 		 1310 aa  191  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378502  normal  0.114253 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2632  ATP-dependent helicase HrpA  28.34 
 
 		 1326 aa  191  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0107317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2065  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1403 aa  190  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5464  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1402 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20230  ATP-dependent helicase HrpA  32.58 
 
 		 1297 aa  190  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20181  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5922  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1402 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2155  ATP-dependent helicase HrpA  31.8 
 
 		 1314 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2173  ATP-dependent helicase HrpA  31.8 
 
 		 1298 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965299 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0950  ATP-dependent helicase HrpA  27.39 
 
 		 1342 aa  189  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2008  ATP-dependent helicase HrpA  29.96 
 
 		 1275 aa  188  6e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02340  conserved hypothetical protein  27.8 
 
 		 1295 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1301  ATP-dependent helicase HrpA  31.34 
 
 		 1281 aa  187  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.144172  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1116  ATP-dependent helicase HrpA  31.43 
 
 		 1378 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497244  normal  0.879417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3448  ATP-dependent helicase HrpA  32.42 
 
 		 1355 aa  187  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2519  ATP-dependent helicase HrpA  28.69 
 
 		 1308 aa  187  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2587  ATP-dependent RNA helicase HrpA  31.48 
 
 		 1295 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1393  ATP-dependent helicase HrpA  29.75 
 
 		 1329 aa  187  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18937  predicted protein  27.79 
 
 		 873 aa  186  3e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2065  ATP-dependent helicase HrpA  31.51 
 
 		 1323 aa  185  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.089901  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1513  ATP-dependent helicase HrpA  31.72 
 
 		 1428 aa  185  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.667066  normal  0.224105 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2642  ATP-dependent helicase HrpA  31.38 
 
 		 1375 aa  185  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.858126  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2776  ATP-dependent helicase HrpA  31.38 
 
 		 1375 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1384  ATP-dependent helicase HrpA  32.98 
 
 		 1305 aa  184  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.144914  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1838  ATP-dependent helicase HrpA  31.38 
 
 		 1380 aa  184  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00763421  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0581  ATP-dependent helicase HrpA  29.88 
 
 		 1361 aa  184  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2243  ATP-dependent helicase HrpA  27.41 
 
 		 1375 aa  183  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3518  ATP-dependent helicase HrpA  32.06 
 
 		 1306 aa  183  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1101  ATP-dependent helicase HrpA  29.09 
 
 		 1296 aa  183  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0458286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1374  ATP-dependent helicase HrpA  31.8 
 
 		 1353 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1750  ATP-dependent helicase HrpA  31.58 
 
 		 1375 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.31583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2259  ATP-dependent helicase HrpA  31.58 
 
 		 1375 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1531  ATP-dependent helicase HrpA  31.58 
 
 		 1375 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3060  ATP-dependent helicase HrpA  31.58 
 
 		 1375 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0643813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2698  ATP-dependent helicase HrpA  31.17 
 
 		 1375 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.897779  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3692  ATP-dependent helicase HrpA  27.68 
 
 		 1282 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.227256  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1488  ATP-dependent helicase HrpA  31.49 
 
 		 1462 aa  182  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2622  ATP-dependent helicase HrpA  30.77 
 
 		 1320 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194923  normal  0.85218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0113  ATP-dependent helicase HrpA  30.5 
 
 		 1560 aa  181  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00159234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0162  HrpA-like helicase  29.05 
 
 		 1378 aa  181  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1469  ATP-dependent helicase HrpA  27.71 
 
 		 1325 aa  181  9e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0240  ATP-dependent helicase HrpA  29.15 
 
 		 1435 aa  181  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7352  ATP-dependent helicase  31.67 
 
 		 824 aa  181  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4053  ATP-dependent helicase HrpA  31.86 
 
 		 1301 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44062  predicted protein  29.48 
 
 		 1943 aa  180  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284084  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3840  ATP-dependent helicase HrpA  32.07 
 
 		 1301 aa  179  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2069  ATP-dependent helicase HrpA  30.8 
 
 		 1316 aa  179  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1883  ATP-dependent helicase HrpA  30.64 
 
 		 1305 aa  179  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1447  ATP-dependent helicase HrpA  27.49 
 
 		 1291 aa  178  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.236687  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01363  ATP dependent RNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09240)  29.55 
 
 		 670 aa  178  7e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0856  ATP-dependent helicase HrpA  28.94 
 
 		 823 aa  177  9e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.255594  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4546  ATP-dependent helicase HrpA  31.65 
 
 		 1301 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3426  ATP-dependent helicase HrpA  30.25 
 
 		 1329 aa  177  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1344  ATP-dependent helicase HrpA  31.65 
 
 		 1301 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.291954 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0283  ATP-dependent helicase HrpA  30.83 
 
 		 1394 aa  177  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2556  ATP-dependent helicase HrpA  30.53 
 
 		 1341 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0904088  hitchhiker  0.00638433 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2430  ATP-dependent helicase HrpA  30.79 
 
 		 1295 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0980  ATP-dependent helicase HrpA  28.35 
 
 		 1307 aa  175  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0688  ATP-dependent RNA helicase HrpB  31.6 
 
 		 809 aa  175  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0972793  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1261  ATP-dependent helicase HrpA  31.09 
 
 		 1330 aa  175  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.949394  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07830  ATP-dependent helicase HrpA  30.06 
 
 		 1367 aa  174  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5576  ATP-dependent helicase HrpA  28.18 
 
 		 1307 aa  175  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0808  ATP-dependent helicase HrpA  33.62 
 
 		 1231 aa  174  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2232  ATP-dependent helicase HrpB  32.39 
 
 		 842 aa  173  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0479151  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1507  ATP-dependent helicase HrpA  30.7 
 
 		 1291 aa  173  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0651  ATP-dependent helicase HrpA  28.79 
 
 		 1466 aa  172  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1546  ATP-dependent helicase HrpA  29.72 
 
 		 1341 aa  171  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2192  ATP-dependent helicase HrpA  30.22 
 
 		 1222 aa  171  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.861211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2313  ATP-dependent helicase HrpA  29.72 
 
 		 1341 aa  170  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>