41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41042 on replicon NC_011695
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011695  PHATRDRAFT_41042  predicted protein  100 
 
 
885 aa  1813    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.718194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.68 
 
 
1553 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  40 
 
 
1652 aa  54.7  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  35 
 
 
1188 aa  51.2  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  21.39 
 
 
1831 aa  50.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  32.65 
 
 
1858 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.43 
 
 
1510 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.43 
 
 
1161 aa  49.3  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.47 
 
 
1481 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  34.62 
 
 
578 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 
1161 aa  47.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  38.89 
 
 
320 aa  48.1  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.73 
 
 
1190 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.71 
 
 
1552 aa  47.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  45.1 
 
 
1097 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.84 
 
 
692 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  36.78 
 
 
1304 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.05 
 
 
696 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.73 
 
 
1373 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.74 
 
 
1474 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
1164 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.28 
 
 
636 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  35.87 
 
 
1661 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 
344 aa  45.8  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  39.58 
 
 
1229 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  31.43 
 
 
316 aa  46.2  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  39.29 
 
 
324 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  47.73 
 
 
828 aa  45.4  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  20.82 
 
 
1411 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.42 
 
 
1004 aa  45.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.57 
 
 
1399 aa  45.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41794  predicted protein  30.53 
 
 
495 aa  45.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0300608  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.43 
 
 
1789 aa  45.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.17 
 
 
1217 aa  45.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.44 
 
 
1363 aa  45.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  31.11 
 
 
344 aa  45.1  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.55 
 
 
1711 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.55 
 
 
1686 aa  44.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.55 
 
 
1760 aa  44.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.41 
 
 
1211 aa  44.7  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  31.87 
 
 
778 aa  44.3  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>