152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40901 on replicon NC_011694
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011694  PHATRDRAFT_40901  predicted protein  100 
 
 
405 aa  844    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32113  predicted protein  50.62 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0250041 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53719  Cytoplasmic tryptophanyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 
424 aa  371  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10475  tryptophanyl-tRNA synthetase (AFU_orthologue; AFUA_2G01640)  47.71 
 
 
424 aa  355  6.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00430  tryptophan-tRNA ligase, putative  46.65 
 
 
641 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2178  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 
381 aa  324  1e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.774939  hitchhiker  0.000339901 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1431  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
386 aa  301  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.494991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1490  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
370 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.624592 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1822  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 
374 aa  260  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0454  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
379 aa  259  8e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0587  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
386 aa  258  9e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1666  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
377 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1612  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
374 aa  251  2e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1942  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
383 aa  231  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3651  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
412 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2089  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1485  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.91 
 
 
361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0904  tryptophanyl-tRNA synthetase  30.08 
 
 
358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1817  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.31 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1078  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
358 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0839  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.64 
 
 
357 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.138022  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0368  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.55 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1426  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.31 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1863  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
534 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.397905  normal  0.0397289 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1670  tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
537 aa  65.1  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1694  Tryptophan--tRNA ligase  35.37 
 
 
570 aa  63.5  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1374  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 
473 aa  63.5  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0665  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
540 aa  62.4  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.383548  normal  0.528912 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0571  Tryptophan--tRNA ligase  24.43 
 
 
417 aa  61.2  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0806588  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.57 
 
 
326 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0656  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.73 
 
 
418 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.52588  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1369  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
418 aa  60.5  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.916392  hitchhiker  0.0000028509 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0642  tryptophan--tRNA ligase  23.37 
 
 
418 aa  60.5  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3620  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
542 aa  60.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1732  tryptophan--tRNA ligase  24.91 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1425  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.3 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.790608  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2168  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.31 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00044454  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.58 
 
 
340 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  26.3 
 
 
346 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003890  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.76 
 
 
340 aa  56.6  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.18 
 
 
328 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.18 
 
 
328 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1800  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.85 
 
 
341 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  25 
 
 
333 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06790  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.8 
 
 
384 aa  54.3  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.118631  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1026  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.93 
 
 
345 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1588  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.43 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00279231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  25.08 
 
 
337 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0042  tyrosyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
338 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.46 
 
 
342 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1856  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.85 
 
 
339 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2364  tryptophanyl-tRNA synthetase II  25.49 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.925711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  25.08 
 
 
331 aa  52.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  22.8 
 
 
346 aa  52.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1058  tyrosyl-tRNA synthetase  25.55 
 
 
361 aa  50.8  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.07011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4862  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.06 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.217158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4909  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.06 
 
 
337 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.229127  normal  0.0358583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  20.91 
 
 
327 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2351  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.25 
 
 
327 aa  49.7  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.548637  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01774  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.3 
 
 
340 aa  49.7  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  20.82 
 
 
351 aa  49.3  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0342  tryptophanyl-tRNA synthetase  29.82 
 
 
336 aa  49.7  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.12931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4912  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.06 
 
 
337 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11705  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.316613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0237  tyrosyl-tRNA synthetase  25.18 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657814  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4838  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.2 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2955  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2999  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  0.333851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1652  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2970  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  0.024912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4762  tryptophanyl-tRNA synthetase II  24.06 
 
 
337 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.586002 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  24.5 
 
 
354 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1847  tyrosyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
418 aa  47.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.032326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1411  tryptophanyl-tRNA synthetase  27.42 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000050643  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.93 
 
 
352 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000761726 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0894  tyrosyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
374 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.652771  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0158  tyrosyl-tRNA synthetase  40 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0103805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2831  tyrosyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1932  tyrosyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
372 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  20.56 
 
 
327 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.31 
 
 
341 aa  47.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 
335 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.26 
 
 
327 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf703  tryptophanyl-tRNA synthetase  26.22 
 
 
331 aa  47  0.0006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  22.46 
 
 
340 aa  47  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0733  tyrosyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
372 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  22.88 
 
 
335 aa  46.6  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25540  tyrosyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 
424 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.94 
 
 
327 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0874  tryptophanyl-tRNA synthetase  21.95 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0512  tryptophanyl-tRNA synthetase II  23.34 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1619  tyrosyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321984  normal  0.630181 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1777  tyrosyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
315 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1559  tyrosyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.363334 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>