More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40779 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_40779  predicted protein  100 
 
 		 685 aa  1391    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26048  MFS family transporter: multidrug efflux  24.79 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00479795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 383 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 406 aa  72  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  31.48 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 387 aa  69.7  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  22.47 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 408 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 385 aa  66.6  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 391 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 422 aa  67  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  24.14 
 
 		 400 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  29.84 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2461  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.23997  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.7 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 398 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 398 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 408 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 413 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4329  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.276417  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4098  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  25.73 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4174  major facilitator superfamily transporter  25.27 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 414 aa  62  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 421 aa  62  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3285  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.69 
 
 		 607 aa  60.8  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 423 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 243 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 419 aa  60.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5862  major facilitator superfamily transporter  25.13 
 
 		 425 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 456 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2132  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.367768  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02050  arabinose efflux permease family protein  21.16 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.205652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2904  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0296  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.22 
 
 		 531 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.03 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.16 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  22.16 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1278  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1277  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0413  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.08 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.86 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26513  MFS family transporter: multidrug efflux  28.28 
 
 		 442 aa  58.5  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0853382  normal  0.0548675 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07167  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  24.17 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 454 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  23.01 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  23.01 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  23.01 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1717  MFS transporter  30.61 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.24 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  28.21 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  22.31 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  28.21 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2676  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  26.07 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45584  predicted protein  23.6 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  26.4 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 383 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 405 aa  56.6  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>