17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40731 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_40731  predicted protein  100 
 
 
584 aa  1188    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.247124  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30899  AAAP family transporter: amino acid  28.82 
 
 
529 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45709  predicted protein  23.31 
 
 
472 aa  99.8  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000165254  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02460  transporter, putative  23.25 
 
 
482 aa  87.8  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70212  Vacuolar amino acid transporter 7  24.05 
 
 
449 aa  85.5  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  25.99 
 
 
647 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10338  amino acid transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09300)  24.03 
 
 
448 aa  80.9  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.749689  normal  0.867713 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  22.82 
 
 
555 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04750  conserved hypothetical protein  23.04 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0726968  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  22.25 
 
 
594 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57811  predicted protein  23.03 
 
 
424 aa  65.1  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00397212  normal  0.0130969 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42888  predicted protein  21.21 
 
 
564 aa  57.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0590475  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28839  AAAP family transporter: amino acid  24.44 
 
 
744 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.046591  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_25632  AAAP family transporter: amino acid  28.3 
 
 
467 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49278  predicted protein  24.73 
 
 
618 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03550  conserved hypothetical protein  19.84 
 
 
525 aa  45.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.368686  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  29.08 
 
 
474 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>