10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40716 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32339  predicted protein  75.81 
 
 
666 aa  775    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  unclonable  0.000000123305  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33478  predicted protein  88.76 
 
 
428 aa  764    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00955149  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36115  predicted protein  82.32 
 
 
782 aa  887    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000280602  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40716  predicted protein  100 
 
 
542 aa  1143    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43943  predicted protein  53.02 
 
 
799 aa  561  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49381  predicted protein  53.02 
 
 
969 aa  560  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.158773  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42534  predicted protein  56.06 
 
 
140 aa  84.7  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288065  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35852  predicted protein  63.64 
 
 
422 aa  73.6  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.318034  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42879  predicted protein  55.77 
 
 
405 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46954  predicted protein  28.23 
 
 
720 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0187117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>