73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40691 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_40691  predicted protein  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.464967  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54101  predicted protein  61.24 
 
 
471 aa  210  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.644826  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26029  predicted protein  58.01 
 
 
478 aa  205  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000382516  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2032  predicted protein  51.98 
 
 
442 aa  184  9e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.688536  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1319  nitrate/nitrite transporter  41.14 
 
 
438 aa  121  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2381  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 
434 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.221879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5402  major facilitator superfamily MFS_1  41.18 
 
 
431 aa  114  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54560  predicted protein  45.99 
 
 
526 aa  113  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.548849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2061  major facilitator superfamily MFS_1  40.97 
 
 
436 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_2171  predicted protein  41.62 
 
 
439 aa  102  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  39.16 
 
 
494 aa  100  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  39.13 
 
 
451 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2773  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 
434 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3052  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03167  high affinity nitrate transporter transmembrane protein  38.22 
 
 
441 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0455784  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1343  major facilitator transporter  36.26 
 
 
441 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  0.258737 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5796  major facilitator transporter  37.74 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3861  major facilitator transporter  37.74 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.490753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4507  major facilitator transporter  37.74 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00396099  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4401  major facilitator transporter  37.11 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  0.0892068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3937  major facilitator transporter  37.11 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.526617  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4146  major facilitator transporter  38.99 
 
 
441 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0582017 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4163  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1169  nitrate transporter, putative  37.89 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0115778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2642  nitrate transporter  36.55 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.436461 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2271  nitrate transporter  35.86 
 
 
513 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4275  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0601  MFS nitrate/nitrite transporter  34.29 
 
 
493 aa  73.2  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4817  nitrate transporter  35.63 
 
 
437 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.438649  normal  0.974789 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1320  major facilitator transporter  34.29 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00399  High affinity nitrate transporter NrtBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X193]  31.91 
 
 
497 aa  70.1  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.155004  normal  0.598208 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4950  nitrate permease  28.33 
 
 
493 aa  68.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  34.53 
 
 
489 aa  68.9  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1551  major facilitator transporter  33.8 
 
 
500 aa  68.6  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00504372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3139  major facilitator superfamily transporter  31.58 
 
 
501 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  36.92 
 
 
502 aa  68.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2419  major facilitator transporter  28.49 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0662  major facilitator transporter  35.38 
 
 
504 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2277  nitrate transporter  36.71 
 
 
490 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.204683 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2626  major facilitator transporter  31.82 
 
 
491 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4859  major facilitator transporter  39.39 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1964  nitrate/nitrite transporter  32.79 
 
 
491 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3528  nitrite transporter  35.38 
 
 
525 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438078 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5658  major facilitator transporter  33.33 
 
 
433 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2467  nitrite transporter  35.38 
 
 
533 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0083  putative nitrate transporter  37.96 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1087  putative nitrate transporter  37.96 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0244  nitrate transporter  37.96 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0337  putative nitrate transporter  37.96 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.510799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  35.38 
 
 
534 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1755  putative nitrite transporter  37.96 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.350912  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1666  putative nitrite transporter  37.96 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1250  putative nitrate transporter  37.96 
 
 
441 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145167  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0247  nitrate transporter  28.9 
 
 
489 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  32.62 
 
 
488 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1877  nitrite transporter  30.12 
 
 
488 aa  62.4  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.108143  hitchhiker  0.00227018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1813  nitrite transporter  36.51 
 
 
488 aa  61.6  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.920075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  32.35 
 
 
491 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2763  nitrite transporter  32.69 
 
 
489 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.178731 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1007  major facilitator transporter  35.88 
 
 
502 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0945762  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  35.71 
 
 
488 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01008  Nitrate transporter (Nitrate permease) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P22152]  26.62 
 
 
507 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.685038  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2278  cellulose-binding family II protein  28.46 
 
 
496 aa  46.2  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0826751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  28.28 
 
 
426 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.17 
 
 
426 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.17 
 
 
426 aa  45.1  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.17 
 
 
426 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.17 
 
 
426 aa  45.1  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  29.17 
 
 
426 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  29.17 
 
 
426 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  29.17 
 
 
409 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
417 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  26.24 
 
 
409 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>