More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40690 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_40690  predicted protein  100 
 
 
331 aa  682    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  32.93 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  32.58 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.55 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 
247 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  30.17 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  30.18 
 
 
505 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.9 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.59 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  28.57 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33244  predicted protein  34.39 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.500627  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  29.65 
 
 
497 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  27.75 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.33 
 
 
272 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 
503 aa  65.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06650  conserved hypothetical protein  27.83 
 
 
418 aa  65.5  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.179039  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  28.8 
 
 
271 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  28.98 
 
 
479 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2623  peptidase M48  32.8 
 
 
250 aa  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0128988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.24 
 
 
529 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  27.08 
 
 
264 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  28.32 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  30.36 
 
 
266 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  32.07 
 
 
436 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  31.85 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 
248 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1013  peptidase M48, Ste24p  31.61 
 
 
232 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.389833  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1589  peptidase M48, Ste24p  30.94 
 
 
244 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  27.93 
 
 
269 aa  63.5  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  29.31 
 
 
497 aa  63.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  28.64 
 
 
255 aa  62.8  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  26.15 
 
 
376 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  27.81 
 
 
488 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.5 
 
 
262 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  28.65 
 
 
268 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  29.32 
 
 
487 aa  61.2  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  28.77 
 
 
494 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.82 
 
 
266 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  28.77 
 
 
494 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 
427 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
269 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  28.77 
 
 
524 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  31.3 
 
 
487 aa  60.8  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1069  peptidase M48 Ste24p  30.14 
 
 
488 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 
496 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  26.51 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 
494 aa  60.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  31.11 
 
 
432 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2978  peptidase M48, Ste24p  29.32 
 
 
487 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.604124  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  29.77 
 
 
487 aa  60.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  27.93 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  29.01 
 
 
487 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  29.01 
 
 
487 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  29.01 
 
 
487 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  29.01 
 
 
487 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  29.38 
 
 
497 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  29.01 
 
 
487 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  28.57 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
269 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  28.57 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  28.57 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  28.57 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
487 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  28.57 
 
 
487 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 
493 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 
267 aa  59.3  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  30.39 
 
 
284 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2987  peptidase M48 Ste24p  28.08 
 
 
487 aa  59.7  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.595956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  31.68 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  27.12 
 
 
494 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  26.82 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2336  hypothetical protein  30.41 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.352855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  28.49 
 
 
524 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1012  peptidase M48, Ste24p  30.41 
 
 
243 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  28.32 
 
 
520 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  25.14 
 
 
492 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  32.73 
 
 
275 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  27.23 
 
 
513 aa  57.4  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  29.5 
 
 
293 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  24.62 
 
 
516 aa  57.8  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0608  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.485097  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  29.24 
 
 
487 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  29.24 
 
 
500 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 
305 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 
478 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  26.29 
 
 
278 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  28.38 
 
 
487 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  26.74 
 
 
483 aa  56.2  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  25.71 
 
 
262 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.38 
 
 
487 aa  56.2  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  30.93 
 
 
479 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2172  peptidase M48, Ste24p  36.22 
 
 
267 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.441617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>