29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40644 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_40644  predicted protein  100 
 
 
876 aa  1825    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50635  predicted protein  38.83 
 
 
843 aa  503  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47597  predicted protein  38.41 
 
 
810 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47518  predicted protein  37.47 
 
 
953 aa  448  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668741  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36118  predicted protein  35.5 
 
 
880 aa  449  1.0000000000000001e-124  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0289305  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49115  predicted protein  35.07 
 
 
870 aa  400  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00818275  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50634  predicted protein  48.14 
 
 
528 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.324652  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46249  predicted protein  31.1 
 
 
831 aa  355  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0849514  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36106  predicted protein  31.4 
 
 
827 aa  348  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36105  predicted protein  49.35 
 
 
419 aa  305  2.0000000000000002e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.592861  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46198  predicted protein  49.68 
 
 
445 aa  304  4.0000000000000003e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.930439  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0823  hypothetical protein  28.74 
 
 
1256 aa  240  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1284  hypothetical protein  23.98 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00324904  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5170  hypothetical protein  26.14 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0557  hypothetical protein  22.31 
 
 
405 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116772  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0310  hypothetical protein  23.81 
 
 
431 aa  63.9  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.321856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0304  hypothetical protein  23.75 
 
 
431 aa  62.8  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0201932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4528  hypothetical protein  22.13 
 
 
402 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679058  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3710  hypothetical protein  26.78 
 
 
407 aa  62  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3576  hypothetical protein  26.78 
 
 
410 aa  62  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4015  hypothetical protein  26.23 
 
 
407 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3705  hypothetical protein  23.64 
 
 
388 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4020  hypothetical protein  23.64 
 
 
388 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3571  hypothetical protein  23.64 
 
 
388 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3628  hypothetical protein  23.93 
 
 
433 aa  57.8  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.351343  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3266  hypothetical protein  22.53 
 
 
411 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.812163  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3786  hypothetical protein  24.08 
 
 
434 aa  52  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0027021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2696  hypothetical protein  21.62 
 
 
395 aa  47  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000585774  normal  0.273153 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0778  hypothetical protein  18.02 
 
 
340 aa  44.7  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>