18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40517 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_40517  predicted protein  100 
 
 
501 aa  1021    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07777  amino acid transporter (Eurofung)  28.14 
 
 
580 aa  144  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.14577  normal  0.468629 
 
 
-
 
NC_006686  CND06100  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
819 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0680473  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04477  amino acid transporter (Eurofung)  29.57 
 
 
739 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49568  predicted protein  25.05 
 
 
605 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.110101  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_87014  predicted protein  26.35 
 
 
621 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.728691  normal  0.601954 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81023  predicted protein  25.64 
 
 
670 aa  100  7e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45824  predicted protein  26.71 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122291  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39978  predicted protein  23.73 
 
 
688 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45915  AAAP family transporter: amino acid  22.72 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9355  predicted protein  23.52 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0272446  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60861  predicted protein  22.04 
 
 
544 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.78945  normal  0.726976 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_25632  AAAP family transporter: amino acid  24.94 
 
 
467 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79777  predicted protein  20.72 
 
 
598 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.405101  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04428  amino acid transporter (Eurofung)  22.91 
 
 
555 aa  50.1  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.227586  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45260  predicted protein  23.7 
 
 
594 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45974  predicted protein  20.77 
 
 
452 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49073  predicted protein  22.31 
 
 
647 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0691142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>