More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40278 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  70.84 
 
 
1038 aa  1436    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48046  predicted protein  65.53 
 
 
678 aa  763    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  51.61 
 
 
982 aa  932    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  100 
 
 
934 aa  1938    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  56.1 
 
 
848 aa  642    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  39.46 
 
 
486 aa  201  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  40.07 
 
 
427 aa  200  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  43.53 
 
 
253 aa  199  3e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  41.85 
 
 
907 aa  197  6e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  35.92 
 
 
2415 aa  197  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  41.56 
 
 
741 aa  194  6e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  41.7 
 
 
3060 aa  191  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  43.03 
 
 
331 aa  191  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  35.24 
 
 
521 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  42.37 
 
 
497 aa  182  2e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  39.74 
 
 
377 aa  181  8e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  42.92 
 
 
2670 aa  179  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  37.66 
 
 
862 aa  177  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  43.4 
 
 
634 aa  176  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  39.34 
 
 
500 aa  171  8e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  37.65 
 
 
857 aa  169  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  35.47 
 
 
647 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  36.78 
 
 
1575 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  35.52 
 
 
789 aa  165  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  40 
 
 
300 aa  165  4.0000000000000004e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  37.76 
 
 
399 aa  164  1e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  30.43 
 
 
467 aa  161  6e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  35.51 
 
 
862 aa  161  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  36.82 
 
 
395 aa  159  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  35.9 
 
 
323 aa  158  4e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  33.09 
 
 
452 aa  158  4e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  46 
 
 
279 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  45.51 
 
 
250 aa  156  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  42.42 
 
 
251 aa  153  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  39.15 
 
 
774 aa  154  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  31.44 
 
 
451 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  42.29 
 
 
414 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  34.4 
 
 
800 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  42.23 
 
 
933 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  36.92 
 
 
450 aa  148  6e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  38.17 
 
 
309 aa  148  6e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  37.37 
 
 
762 aa  145  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  45.18 
 
 
250 aa  145  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  40.25 
 
 
609 aa  144  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  42.17 
 
 
405 aa  144  7e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  38.86 
 
 
754 aa  141  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  38.95 
 
 
1214 aa  141  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  38.84 
 
 
558 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  37.61 
 
 
321 aa  137  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  29.47 
 
 
898 aa  127  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  48.7 
 
 
509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  36.14 
 
 
399 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  39.07 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  40 
 
 
204 aa  117  6.9999999999999995e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  34.81 
 
 
1227 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  37.04 
 
 
272 aa  115  3e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  34.13 
 
 
200 aa  115  5e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  37.16 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  36.47 
 
 
226 aa  110  1e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  40.13 
 
 
180 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  32.95 
 
 
275 aa  101  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  38.61 
 
 
288 aa  100  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  55.56 
 
 
228 aa  99.4  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  39.85 
 
 
166 aa  95.9  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_6189  predicted protein  31.8 
 
 
272 aa  94.7  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  30.77 
 
 
414 aa  92.4  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  41.74 
 
 
658 aa  92  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  42.42 
 
 
913 aa  91.7  7e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  32.5 
 
 
758 aa  89.7  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  47.67 
 
 
190 aa  89.4  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  41.24 
 
 
182 aa  88.6  5e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38832  predicted protein  30.04 
 
 
372 aa  87.8  9e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00223865  hitchhiker  0.00603177 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  45.74 
 
 
236 aa  85.9  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0134  hypothetical protein  43.75 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39208  predicted protein  29.26 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0531035  normal  0.339331 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  39.25 
 
 
560 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.47 
 
 
798 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  50 
 
 
369 aa  83.2  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 
598 aa  82.8  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  37.82 
 
 
423 aa  80.5  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  26.81 
 
 
809 aa  80.5  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  30.74 
 
 
597 aa  80.9  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1443  hypothetical protein  28.69 
 
 
1053 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.639099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  28.62 
 
 
620 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.33 
 
 
613 aa  80.1  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  39.5 
 
 
446 aa  79  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  31.8 
 
 
985 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 
700 aa  78.6  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  29.41 
 
 
661 aa  78.6  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
615 aa  78.2  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.39 
 
 
499 aa  78.2  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3446  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.67 
 
 
540 aa  78.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10499  predicted protein  30.61 
 
 
330 aa  78.2  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.181125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.51 
 
 
601 aa  78.2  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_45682  predicted protein  26.79 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.382803  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 
582 aa  77.8  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0308  hypothetical protein  39.42 
 
 
181 aa  77  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  43.16 
 
 
219 aa  77.4  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51117  predicted protein  25.88 
 
 
685 aa  77  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0207292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  27.41 
 
 
707 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>