92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4021 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_4021  predicted protein  100 
 
 		 163 aa  339  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.274127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  49.66 
 
 		 495 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  49.66 
 
 		 495 aa  156  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  43.56 
 
 		 489 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  43.56 
 
 		 488 aa  148  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  46.26 
 
 		 497 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  46.26 
 
 		 497 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  49.26 
 
 		 501 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  42.94 
 
 		 491 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  42.33 
 
 		 493 aa  144  5e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  41.1 
 
 		 489 aa  141  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  42.18 
 
 		 495 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  40.4 
 
 		 510 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  40.82 
 
 		 507 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  39.86 
 
 		 494 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  39.19 
 
 		 494 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  39.86 
 
 		 494 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_86865  predicted protein  45.78 
 
 		 554 aa  125  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.241734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  38.1 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  40.85 
 
 		 468 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  40.85 
 
 		 468 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  38.31 
 
 		 472 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  35.29 
 
 		 533 aa  101  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  40 
 
 		 509 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  37.96 
 
 		 477 aa  97.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  40.3 
 
 		 517 aa  97.1  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  35 
 
 		 464 aa  95.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1244  carotenoid oxygenase  37.32 
 
 		 556 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0442261  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3066  Carotenoid oxygenase  37.32 
 
 		 558 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.061004  hitchhiker  0.0000000132751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1288  carotenoid oxygenase  37.32 
 
 		 554 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528505  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1322  carotenoid oxygenase  37.32 
 
 		 556 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487019 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  35.37 
 
 		 508 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  34.56 
 
 		 502 aa  89  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  35.37 
 
 		 508 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  34.42 
 
 		 486 aa  88.2  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  36.84 
 
 		 485 aa  87  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3052  carotenoid oxygenase  36.09 
 
 		 515 aa  86.3  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  37.88 
 
 		 481 aa  85.1  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  37.59 
 
 		 514 aa  81.3  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  37.78 
 
 		 520 aa  81.3  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  33.85 
 
 		 470 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  36.84 
 
 		 504 aa  79.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  34.29 
 
 		 551 aa  78.2  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  36.3 
 
 		 499 aa  77.4  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  32.33 
 
 		 466 aa  74.3  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0091  Carotenoid oxygenase  32.06 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.848261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  30 
 
 		 464 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  34.11 
 
 		 487 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  31.85 
 
 		 765 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  35.38 
 
 		 488 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  33.33 
 
 		 487 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  33.1 
 
 		 481 aa  71.2  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  31.11 
 
 		 473 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  34.65 
 
 		 460 aa  68.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  37.4 
 
 		 472 aa  68.2  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  33.33 
 
 		 497 aa  67.4  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28795  predicted protein  27.92 
 
 		 556 aa  67  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.813535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  34.65 
 
 		 477 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  32.61 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  32.28 
 
 		 488 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  31.78 
 
 		 555 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  33.88 
 
 		 914 aa  63.9  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  32.35 
 
 		 483 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  30.28 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  29.46 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  30.3 
 
 		 494 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  31.47 
 
 		 470 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43490  predicted protein  26.29 
 
 		 630 aa  60.1  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  28.68 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48408  predicted protein  32.89 
 
 		 577 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3700  Carotenoid oxygenase  29.55 
 
 		 560 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.101903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  29.79 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  33.07 
 
 		 467 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  31.82 
 
 		 480 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  32.54 
 
 		 467 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  30.16 
 
 		 441 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  26.52 
 
 		 464 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  29.77 
 
 		 467 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  26.76 
 
 		 537 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  30.71 
 
 		 467 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  25.34 
 
 		 496 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  25.34 
 
 		 496 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  30.3 
 
 		 467 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  25.34 
 
 		 496 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  28.79 
 
 		 512 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  26.28 
 
 		 502 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  28.26 
 
 		 459 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  25.93 
 
 		 451 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  25.93 
 
 		 451 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  25.93 
 
 		 451 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  27.78 
 
 		 480 aa  40.8  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  29.03 
 
 		 444 aa  40.8  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>