70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40200 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  100 
 
 
710 aa  1451    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  34.12 
 
 
368 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  34.58 
 
 
375 aa  211  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  35.44 
 
 
369 aa  210  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  33.33 
 
 
368 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  208  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  208  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  208  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  208  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  208  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  207  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  33.6 
 
 
368 aa  207  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  33.77 
 
 
370 aa  198  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  34.7 
 
 
604 aa  197  7e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  32.38 
 
 
379 aa  190  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  31.38 
 
 
372 aa  189  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  32.09 
 
 
366 aa  189  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  29.94 
 
 
401 aa  182  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  34.22 
 
 
366 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  34.22 
 
 
366 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  31.04 
 
 
372 aa  177  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  31.28 
 
 
369 aa  173  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  30.41 
 
 
396 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  29.73 
 
 
385 aa  164  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  27.32 
 
 
363 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  26.93 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.61 
 
 
379 aa  131  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  28.07 
 
 
357 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  30.45 
 
 
401 aa  120  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  23.9 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  24.54 
 
 
365 aa  106  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  26.33 
 
 
365 aa  101  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  22.93 
 
 
367 aa  96.7  1e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.13 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  20.44 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  21.76 
 
 
634 aa  64.3  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.906693 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  28.41 
 
 
314 aa  55.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  28.88 
 
 
443 aa  53.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  30.57 
 
 
277 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  28.98 
 
 
282 aa  51.2  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 
314 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  26.7 
 
 
314 aa  49.7  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  31.25 
 
 
259 aa  48.9  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  28.14 
 
 
369 aa  49.3  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  29.86 
 
 
261 aa  47.8  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  27.87 
 
 
280 aa  47.8  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  27.42 
 
 
288 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  27.66 
 
 
283 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  28.14 
 
 
456 aa  46.6  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  27.41 
 
 
310 aa  46.2  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  26.6 
 
 
323 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  28.95 
 
 
318 aa  46.6  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  28.95 
 
 
318 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  32.53 
 
 
442 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  29.17 
 
 
256 aa  45.8  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  33.33 
 
 
284 aa  45.8  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  27.55 
 
 
460 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  37.61 
 
 
441 aa  45.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  27.04 
 
 
460 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  30.43 
 
 
280 aa  45.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  26.39 
 
 
268 aa  45.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  32.12 
 
 
465 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5109  GTP-binding protein EngA  26.64 
 
 
445 aa  43.9  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314704  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6271  GTP-binding protein EngA  26.64 
 
 
445 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1808  GTP-binding protein EngA  26.64 
 
 
445 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1832  GTP-binding protein EngA  26.64 
 
 
445 aa  44.3  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  30.2 
 
 
441 aa  43.9  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1467  GTP-binding protein EngA  26.64 
 
 
445 aa  43.9  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496612  normal  0.453892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>