More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_4014 on replicon NC_011691
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011691  PHATRDRAFT_4014  predicted protein  100 
 
 
216 aa  440  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5654  predicted protein  66.82 
 
 
234 aa  280  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.221345  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0461  putative periplasmic protease  50.7 
 
 
338 aa  235  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1726  putative periplasmic protease  50.23 
 
 
338 aa  233  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1848  putative periplasmic protease  52.78 
 
 
348 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805473  normal  0.10396 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1430  putative periplasmic protease  52.78 
 
 
348 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.28088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1612  putative periplasmic protease  52.78 
 
 
348 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000117623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1906  putative periplasmic protease  52.78 
 
 
348 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000137079 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0841  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
347 aa  229  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0227554  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0578  putative periplasmic protease  52.97 
 
 
353 aa  227  8e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000048636  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1843  putative periplasmic protease  52.31 
 
 
348 aa  227  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000005383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1707  putative periplasmic protease  51.16 
 
 
347 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003018  SohB protein peptidase U7 family  52.48 
 
 
353 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2659  putative periplasmic protease  51.85 
 
 
348 aa  226  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0477819  unclonable  0.0000000288065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2198  putative periplasmic protease  53.88 
 
 
347 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0917  putative periplasmic protease  50 
 
 
312 aa  224  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0886  putative periplasmic protease  50 
 
 
312 aa  224  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1605  putative periplasmic protease  50.23 
 
 
334 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02863  putative periplasmic protease  51.98 
 
 
353 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1972  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
349 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.114164  normal  0.766223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2181  putative periplasmic protease  52.56 
 
 
344 aa  222  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2166  putative periplasmic protease  51.39 
 
 
348 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0622193  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2314  putative periplasmic protease  51.39 
 
 
348 aa  222  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2013  putative periplasmic protease  51.39 
 
 
348 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0439516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40840  putative periplasmic protease  50 
 
 
341 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01248  predicted inner membrane peptidase  49.54 
 
 
349 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.57179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2377  Peptidase S49 domain protein  49.54 
 
 
349 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00026529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1904  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
349 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180069 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3463  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
341 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1859  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
349 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000140347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2016  putative periplasmic protease  49.07 
 
 
365 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000438973  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1381  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
349 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2356  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
349 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2306  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1471  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
349 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.251936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2036  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.210716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1496  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
349 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1925  putative periplasmic protease  50.46 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0571162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3114  putative periplasmic protease  48.15 
 
 
340 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0953569  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27550  putative periplasmic protease  50.75 
 
 
342 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2903  putative periplasmic protease  47.22 
 
 
343 aa  217  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000180746  normal  0.0386673 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1161  putative periplasmic protease  49.75 
 
 
353 aa  217  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.189873  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1184  putative periplasmic protease  49.29 
 
 
326 aa  217  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.084263  normal  0.0267663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1530  putative periplasmic protease  52.31 
 
 
353 aa  217  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000285162  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1694  putative periplasmic protease  50 
 
 
343 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0077753  normal  0.738833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1759  peptidase S49  49.77 
 
 
356 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.257491  normal  0.0518499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01896  putative periplasmic protease  50.93 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000105224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1651  putative periplasmic protease  48.61 
 
 
342 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000359076  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1202  putative periplasmic protease  48.34 
 
 
324 aa  215  4e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.184937  normal  0.0260504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3211  putative periplasmic protease  48.84 
 
 
339 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.888582  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3556  putative periplasmic protease  48.84 
 
 
339 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132568  normal  0.518214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2407  putative periplasmic protease  49.54 
 
 
343 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000170796  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3922  putative periplasmic protease  48.15 
 
 
339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.113918  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2629  putative periplasmic protease  54.23 
 
 
333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.751964  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0992  putative periplasmic protease  49.28 
 
 
332 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0462132  unclonable  0.000000000696502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1926  putative periplasmic protease  50 
 
 
348 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1913  putative periplasmic protease  48.15 
 
 
339 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.786378  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2119  putative periplasmic protease  50 
 
 
337 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000182338  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2471  putative periplasmic protease  47.2 
 
 
337 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000173214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2530  putative periplasmic protease  50.74 
 
 
339 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.581434  normal  0.322286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2394  putative periplasmic protease  47.44 
 
 
338 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000216852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2570  putative periplasmic protease  48.37 
 
 
336 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2933  putative periplasmic protease  47.44 
 
 
338 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2460  putative periplasmic protease  47.44 
 
 
340 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0165849  hitchhiker  0.0077968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1470  putative periplasmic protease  46.98 
 
 
338 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000101356  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1536  putative periplasmic protease  46.98 
 
 
338 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1193  putative periplasmic protease  50.5 
 
 
349 aa  208  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1938  putative periplasmic protease  49.76 
 
 
349 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0332  putative periplasmic protease  53.2 
 
 
332 aa  208  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1530  putative periplasmic protease  46.98 
 
 
338 aa  208  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000234628  unclonable  0.0000000000765641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2728  peptidase, U7 family  47.44 
 
 
340 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2713  putative periplasmic protease  47.44 
 
 
338 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000822492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2790  putative periplasmic protease  47.44 
 
 
338 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000021118  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1674  putative periplasmic protease  47.44 
 
 
330 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000678362  hitchhiker  0.00314277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2692  putative periplasmic protease  46.98 
 
 
338 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000260799  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1088  putative periplasmic protease  49.02 
 
 
334 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0973  putative periplasmic protease  49.02 
 
 
334 aa  206  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0102  putative periplasmic protease  48.15 
 
 
335 aa  201  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0843  putative periplasmic protease  46.05 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1897  Peptidase S49 domain protein  52.74 
 
 
347 aa  192  2e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_5396  predicted protein  35.98 
 
 
165 aa  111  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.751288  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.05 
 
 
547 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2153  peptidase S49  34.12 
 
 
285 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156713  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4371  peptidase S49  34.25 
 
 
287 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3424  peptidase S49  40.8 
 
 
286 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3297  peptidase S49  40.8 
 
 
286 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.49449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3105  peptidase S49  36.55 
 
 
286 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.246798 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2309  peptidase S49  36.48 
 
 
267 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.701811  normal  0.0237948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2714  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.33 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3180  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.63 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00860  ClpP class periplasmic serine protease  31.71 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.81 
 
 
299 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2757  peptidase S49  31.13 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1076  S49 family peptidase  29.49 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2353  putative serine protease SohB  33.33 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.169927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2737  peptidase S49  31.19 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.224887  normal  0.140523 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  30.34 
 
 
609 aa  80.1  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.36 
 
 
605 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.8 
 
 
617 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3922  peptidase S49  32.18 
 
 
278 aa  79.7  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>