More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_40048 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_40048  predicted protein  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00311694  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41282  predicted protein  100 
 
 		 173 aa  347  7e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000037701  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  57.14 
 
 		 181 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  56.57 
 
 		 181 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  55.43 
 
 		 184 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  53.37 
 
 		 187 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05231  ribosome recycling factor  53.04 
 
 		 182 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  52.25 
 
 		 182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  53.01 
 
 		 186 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3778  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 182 aa  198  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.343725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  50 
 
 		 184 aa  198  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  52.6 
 
 		 173 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4637  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 182 aa  197  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.138932  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0065  ribosome recycling factor  51.12 
 
 		 182 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1853  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  50.54 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  50 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05781  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 182 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  51.09 
 
 		 185 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0710  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 182 aa  194  9e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 184 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  50.28 
 
 		 185 aa  191  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2472  ribosome recycling factor  49.46 
 
 		 185 aa  191  9e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 185 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 186 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  190  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  49.17 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  48.55 
 
 		 184 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 184 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0362  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 190 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0327  ribosome recycling factor  51.61 
 
 		 190 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_12187  predicted protein  49.14 
 
 		 176 aa  188  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3730  ribosome recycling factor  48.63 
 
 		 185 aa  188  7e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000151569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  49.18 
 
 		 185 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10920  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 186 aa  187  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0728725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1649  ribosome recycling factor  47.22 
 
 		 182 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  46.89 
 
 		 184 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1951  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1669  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.17061  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  48.31 
 
 		 184 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1345  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 184 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00867514  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  48.88 
 
 		 186 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1319  ribosome recycling factor  49.45 
 
 		 184 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.362878  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1512  ribosome recycling factor  48.09 
 
 		 185 aa  185  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00300903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0609  ribosome recycling factor  50 
 
 		 174 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000570491  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0826  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 184 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000458151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  47.51 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2291  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000106212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1918  ribosome recycling factor  46.99 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05471  ribosome recycling factor  52.02 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05771  ribosome recycling factor  51.43 
 
 		 182 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.409534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 184 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1003  ribosome recycling factor  47.8 
 
 		 183 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000111257  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0261  ribosome recycling factor  49.74 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  45.11 
 
 		 185 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0292  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05851  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 182 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  45.65 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0687  ribosome recycling factor  47.85 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000279104  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0521  ribosome recycling factor  50.29 
 
 		 182 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2753  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 185 aa  180  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1488  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1253  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000298645  hitchhiker  0.00105804 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0281  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0303  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 188 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1781  ribosome recycling factor  46.7 
 
 		 185 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0804  ribosome recycling factor  48.04 
 
 		 185 aa  178  4.999999999999999e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144692  hitchhiker  0.0000000000784009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  47.83 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  44.57 
 
 		 185 aa  177  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01128  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  45.6 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  46.63 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0305  ribosome recycling factor  48.9 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.422351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2711  ribosome recycling factor  47.54 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0873966  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  42.93 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  48.28 
 
 		 185 aa  176  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  43.72 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  42.39 
 
 		 185 aa  175  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3928  ribosome recycling factor  44.02 
 
 		 185 aa  175  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  normal  0.119713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0445  ribosome recycling factor  43.17 
 
 		 185 aa  175  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00199228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  48.35 
 
 		 184 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1196  ribosome recycling factor  49.44 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000300081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  46.55 
 
 		 185 aa  174  8e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2016  ribosome recycling factor  43.48 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1200  ribosome recycling factor  44.26 
 
 		 185 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000906097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0632  ribosome recycling factor  47.19 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  hitchhiker  0.00509823 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>