More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39994 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_39994  Mer3 meiotic cross-over helicase  100 
 
 		 1710 aa  3556    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31874  predicted protein  31.03 
 
 		 1060 aa  324  9.000000000000001e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.630707 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05514  DEAD/DEAH box DNA helicase (Mer3), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13080)  30.36 
 
 		 1385 aa  312  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451829  normal  0.647308 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00970  DNA helicase, putative  28.48 
 
 		 1465 aa  310  1.0000000000000001e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.530754  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02482  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03070)  30.28 
 
 		 2015 aa  292  4e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.573711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01550  RNA helicase, putative  31.08 
 
 		 1770 aa  288  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54312  DNA-directed DNA polymerase  29.55 
 
 		 1942 aa  285  4.0000000000000003e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.300419  normal  0.259296 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04330  pre-mRNA splicing factor, putative  31.89 
 
 		 2152 aa  285  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51353  RNA helicase-related protein required for pre-mRNA splicing  31.2 
 
 		 2111 aa  285  8.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42332  predicted protein  32.39 
 
 		 1767 aa  280  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10194  pre-mRNA splicing helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04740)  31.29 
 
 		 2208 aa  276  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21388  predicted protein  30.34 
 
 		 2189 aa  273  1e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0338841  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44002  predicted protein  31.41 
 
 		 2157 aa  271  7e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.507692  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25  predicted protein  30.01 
 
 		 1589 aa  268  8e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1659  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.41 
 
 		 800 aa  220  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.63 
 
 		 780 aa  219  5e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.540661  normal  0.377809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3604  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.22 
 
 		 803 aa  216  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1673  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.67 
 
 		 785 aa  207  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0671  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.99 
 
 		 807 aa  205  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.44544  normal  0.434553 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0937  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 707 aa  163  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0865986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.84 
 
 		 746 aa  159  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0326457 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1765  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.91 
 
 		 747 aa  158  7e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.71 
 
 		 747 aa  158  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.288055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0243  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 		 709 aa  157  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0266  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.07 
 
 		 715 aa  156  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0401  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.72 
 
 		 694 aa  156  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2501  ski2-like helicase  29.91 
 
 		 712 aa  155  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0560  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.5 
 
 		 707 aa  153  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1280  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.37 
 
 		 707 aa  153  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0030  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.94 
 
 		 751 aa  153  4e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3736  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.68 
 
 		 791 aa  150  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2458  ski2-like helicase  30.94 
 
 		 723 aa  148  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1751  ski2-like helicase  28.92 
 
 		 726 aa  147  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.356939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.91 
 
 		 799 aa  145  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34768  predicted protein  30 
 
 		 874 aa  144  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0821301  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0689  ski2-like helicase  26.77 
 
 		 808 aa  140  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.167802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2794  ski2-like helicase  31.33 
 
 		 727 aa  140  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00114406  normal  0.0559482 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0318  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.98 
 
 		 756 aa  139  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2702  ski2-like helicase  27.61 
 
 		 824 aa  139  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  28.88 
 
 		 799 aa  138  9e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.04 
 
 		 700 aa  137  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0378845 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0800  ski2-like helicase  28.11 
 
 		 693 aa  136  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0498  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.71 
 
 		 739 aa  135  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1207  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.63 
 
 		 662 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000229661  hitchhiker  0.00000914405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3508  ski2-like helicase  26.54 
 
 		 729 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.197475  normal  0.39746 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1151  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.12 
 
 		 706 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  decreased coverage  2.46627e-18 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1102  ski2-like helicase  28.69 
 
 		 760 aa  130  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000802157  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6720  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.69 
 
 		 1230 aa  130  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_33072  predicted protein  28.31 
 
 		 872 aa  126  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988083  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1820  DSH domain-containing protein  27.18 
 
 		 904 aa  125  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.473261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0078  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.7 
 
 		 708 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.605857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2540  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.39 
 
 		 1318 aa  122  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0103  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.08 
 
 		 729 aa  116  4.0000000000000004e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.297331  hitchhiker  0.00614894 
 
 
-
 
NC_006686  CND05090  conserved hypothetical protein  25.05 
 
 		 1068 aa  115  5e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.130071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0179  DEAD/DEAH box helicase-like protein  24.71 
 
 		 825 aa  115  9e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50326  predicted protein  26.52 
 
 		 998 aa  112  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.455166  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36809  Dead-box family helicase required for mRNA export from nucleus  25.71 
 
 		 1068 aa  113  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.787056 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0112  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.08 
 
 		 710 aa  112  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.757622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43137  predicted protein  29.1 
 
 		 402 aa  109  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1245  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.75 
 
 		 845 aa  107  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.73 
 
 		 952 aa  107  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49799  predicted protein  25.44 
 
 		 933 aa  107  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.238463 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02739  DNA-directed DNA polymerase theta, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05260)  23.38 
 
 		 901 aa  105  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.539021  normal  0.18376 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0998  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  25.85 
 
 		 927 aa  105  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3743  DSH domain protein  26.2 
 
 		 889 aa  105  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18671  putative DNA helicase  26.07 
 
 		 927 aa  104  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0815  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.69 
 
 		 816 aa  104  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0130547  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3167  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.19 
 
 		 919 aa  103  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0976741  hitchhiker  0.00000193784 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21930  superfamily II RNA helicase  26.54 
 
 		 918 aa  104  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0392753  normal  0.495503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5856  putative nuclear exosomal RNA helicase MTR4 ; K01529  26.7 
 
 		 909 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.918517 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16471  putative DNA helicase  25.93 
 
 		 908 aa  102  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2902  Type III restriction enzyme, res subunit  25.19 
 
 		 893 aa  100  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000284094 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0627  DEAD/DEAH box helicase-like  26.95 
 
 		 926 aa  100  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.675765  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15871  putative DNA helicase  27.03 
 
 		 924 aa  100  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.273978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1560  DEAD/DEAH box helicase-like  25.23 
 
 		 908 aa  100  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.14763  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16571  putative DNA helicase  24.83 
 
 		 908 aa  100  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50709  predicted protein  25.88 
 
 		 1055 aa  99  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.918381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1324  DEAD/DEAH box helicase-like  25.64 
 
 		 919 aa  97.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3595  ATP-dependent DNA helicase  24.71 
 
 		 825 aa  97.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0142598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.2 
 
 		 832 aa  96.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.17865  normal  0.487568 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0918  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.7 
 
 		 815 aa  96.7  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16691  putative DNA helicase  24.94 
 
 		 908 aa  96.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0470  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.67 
 
 		 853 aa  95.9  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191339  normal  0.0991802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.5 
 
 		 1004 aa  95.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4420  DSH domain-containing protein  24.65 
 
 		 890 aa  95.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0111717  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 1265 aa  95.1  9e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3461  DSH-like  25.33 
 
 		 905 aa  94.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 657 aa  93.2  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000404908 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1035  DEAD/DEAH box helicase domain protein  24.03 
 
 		 697 aa  93.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.061394 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0827  DEAD/DEAH box helicase  26.32 
 
 		 842 aa  92.4  7e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0308  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.43 
 
 		 688 aa  90.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2490  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.29 
 
 		 865 aa  91.3  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.33618  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1453  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.63 
 
 		 869 aa  90.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.115515  normal  0.268809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3073  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.58 
 
 		 762 aa  90.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.650604  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2191  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.16 
 
 		 727 aa  89.7  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0040  superfamily II helicase  26.55 
 
 		 855 aa  89.7  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  24.83 
 
 		 875 aa  88.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6200  putative ATP-dependent helicase  24.11 
 
 		 830 aa  88.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0671676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5640  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25 
 
 		 852 aa  87.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5261  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25 
 
 		 852 aa  87.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>