47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39914 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  100 
 
 		 418 aa  864    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  31.89 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  31.44 
 
 		 312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  30.29 
 
 		 325 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  32.26 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  30.75 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  30.93 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  30.19 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  32.08 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  30.66 
 
 		 313 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  30.71 
 
 		 287 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  29.92 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  30.61 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  26.79 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  25.14 
 
 		 311 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  28.27 
 
 		 310 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  28.38 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  26.04 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  29.19 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  27.35 
 
 		 302 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  23.56 
 
 		 337 aa  89.4  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  26.35 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  23.92 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  28.68 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  24.35 
 
 		 1236 aa  56.6  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1206  B12-dependent methionine synthase  24.28 
 
 		 1232 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1433  methionine synthase I, homocysteine S-methyltransferase  23.08 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.218334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1935  B12-dependent methionine synthase  23.65 
 
 		 1250 aa  50.4  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.688432  normal  0.0193285 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0973  B12-dependent methionine synthase  22.51 
 
 		 1244 aa  50.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0995  B12-dependent methionine synthase  23.33 
 
 		 1244 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0391552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1007  B12-dependent methionine synthase  23.53 
 
 		 1244 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3368  B12-dependent methionine synthase  23.02 
 
 		 1233 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2509  B12-dependent methionine synthase  21.98 
 
 		 1262 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2154  B12-dependent methionine synthase  24.19 
 
 		 1228 aa  46.6  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1982  B12-dependent methionine synthase  24.4 
 
 		 1235 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0368395  normal  0.238169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4366  B12-dependent methionine synthase  22.4 
 
 		 1247 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.778137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2467  methionine synthase  23.1 
 
 		 1261 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  24.08 
 
 		 1226 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  22.43 
 
 		 1225 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  24.29 
 
 		 1228 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3320  B12-dependent methionine synthase  23.87 
 
 		 1235 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.487541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3282  B12-dependent methionine synthase  23.33 
 
 		 1244 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2375  B12-dependent methionine synthase  23.87 
 
 		 1235 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4250  methionine synthase  25 
 
 		 1261 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.49174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2965  B12-dependent methionine synthase  22.51 
 
 		 1244 aa  43.5  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  22.66 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0045  B12-dependent methionine synthase  23.34 
 
 		 1267 aa  43.1  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>