40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39392 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_39392  predicted protein  100 
 
 
1324 aa  2751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192889  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  26.75 
 
 
1130 aa  98.6  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43378  predicted protein  24.07 
 
 
1934 aa  83.6  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  23.37 
 
 
1264 aa  79.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  22.36 
 
 
1298 aa  65.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  22.08 
 
 
1271 aa  64.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  26.91 
 
 
348 aa  62.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2252  adenylate/guanylate cyclase  23.76 
 
 
508 aa  59.3  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.154815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  40.3 
 
 
1169 aa  55.1  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  25.89 
 
 
513 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  36.25 
 
 
729 aa  54.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.8 
 
 
737 aa  52.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
345 aa  52.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.85 
 
 
1360 aa  52.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  32.97 
 
 
643 aa  52  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  24.53 
 
 
441 aa  51.6  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  24.64 
 
 
431 aa  51.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.52 
 
 
1429 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.94 
 
 
650 aa  50.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  22.11 
 
 
1403 aa  49.7  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  22.55 
 
 
1295 aa  50.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  28.97 
 
 
699 aa  49.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.16 
 
 
694 aa  47.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4621  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
687 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.828122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  23.41 
 
 
518 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  30.38 
 
 
741 aa  47  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 
1160 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  24.2 
 
 
1422 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  23.31 
 
 
466 aa  46.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  23.31 
 
 
424 aa  46.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  30.34 
 
 
549 aa  46.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  28.57 
 
 
758 aa  46.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  22.93 
 
 
515 aa  45.8  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  26.54 
 
 
437 aa  46.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  23.32 
 
 
529 aa  45.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  22.42 
 
 
636 aa  45.4  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  25.62 
 
 
911 aa  45.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2161  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  24.85 
 
 
1020 aa  45.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0428251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
406 aa  45.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 
1153 aa  45.4  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>