41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39374 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_39374  predicted protein  100 
 
 		 366 aa  759    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4476  RecB family exonuclease-like protein  29.06 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  27.27 
 
 		 351 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3137  RecB family exonuclease  31.17 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.67707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3199  RecB family exonuclease  31.17 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487401  normal  0.220799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3149  RecB family exonuclease  31.17 
 
 		 277 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.878116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5903  RecB family exonuclease-like protein  30.8 
 
 		 295 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.016661  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1180  RecB family exonuclease  32.43 
 
 		 266 aa  90.9  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  30.26 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  29.28 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1855  putative RecB family exonuclease  31.49 
 
 		 294 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3064  RecB family exonuclease  31.73 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2304  RecB family exonuclease-like protein  30.8 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00598996  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  30.64 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2236  hypothetical protein  28.05 
 
 		 322 aa  86.7  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.636003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2634  RecB family exonuclease  28.43 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4886  hypothetical protein  29.01 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  30.12 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22140  RecB family exonuclease  28.57 
 
 		 333 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.180752  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1198  RecB family exonuclease-like protein  25.49 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0768064  normal  0.151704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1844  RecB family exonuclease-like protein  31.25 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2222  RecB family exonuclease-like protein  26.32 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.839667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2676  hypothetical protein  28.24 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2636  hypothetical protein  27.68 
 
 		 299 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  29.78 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2353  hypothetical protein  27.48 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.978382  normal  0.150681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2456  RecB family exonuclease-like protein  26.06 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1816  hypothetical protein  27.33 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13930  RecB family exonuclease  27.78 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199879  normal  0.841258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2007  RecB family exonuclease-like protein  25.16 
 
 		 284 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2978  RecB family exonuclease-like protein  28.19 
 
 		 323 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129924  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0453  hypothetical protein  24.81 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0515112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0737  hypothetical protein  28.43 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.907261  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  22.55 
 
 		 259 aa  49.3  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  26.96 
 
 		 951 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  37.88 
 
 		 1048 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0683  hypothetical protein  27.92 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.923342  normal  0.810121 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0904  hypothetical protein  25.38 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.107924 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1068  hypothetical protein  24.49 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  29.33 
 
 		 909 aa  43.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0636  hypothetical protein  31.58 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>