22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39090 on replicon NC_011686
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011686  PHATRDRAFT_39090  predicted protein  100 
 
 		 134 aa  279  7.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119493  RING-box protein 1  74.16 
 
 		 110 aa  155  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313077  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08844  RING-box protein 1 (Broad)  50.43 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.43925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37145  Skp1 Cullin-F-box ubiquitin protein ligase (SCF) subunit  51.85 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03140  ubiquitin-protein ligase, putative  46.59 
 
 		 142 aa  95.9  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0134629  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10271  predicted protein  32.95 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.804871  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_9831  predicted protein  32.22 
 
 		 85 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.320101 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10394  anaphase promoting complex subunit Apc11, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01380)  34.12 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.136684  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01290  conserved hypothetical protein  34.67 
 
 		 740 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84817  predicted protein  34.33 
 
 		 568 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86664  ubiquitin-protein ligase Anaphase Promoting Complex  26.47 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67783  predicted protein  28.93 
 
 		 551 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08310  ligase, putative  44.83 
 
 		 883 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46942  predicted protein  28.57 
 
 		 788 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38016  predicted protein  29.51 
 
 		 442 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0971741  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01075  RING finger ubiquitin ligase (Tul1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12080)  29.58 
 
 		 807 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0263562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49494  predicted protein  56.52 
 
 		 235 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_3177  predicted protein  31.67 
 
 		 341 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.80791 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04870  hypothetical protein  36.84 
 
 		 724 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49638  predicted protein  38.1 
 
 		 611 aa  40.4  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  29.76 
 
 		 453 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47516  predicted protein  33.33 
 
 		 403 aa  40.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>